More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0145 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 205 aa  388  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  92.06 
 
 		 205 aa  334  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  51.71 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  41.35 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  39.77 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  39.2 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  34.86 
 
 		 267 aa  94.7  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  39.13 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  39.69 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  35.84 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  34.68 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  37.5 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.74 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  39.76 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  30.1 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  38.46 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  32.87 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  25.64 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  33.14 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.42 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2277  membrane-associated protein-like protein  31.61 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  33.92 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  35.22 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  26.98 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  27.88 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  31.11 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  30 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  25.29 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.94 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  31.31 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  30.77 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.68 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.16 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  30.77 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  30.77 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  30.77 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  30.77 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  30.77 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  26.84 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  26.84 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.57 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  26.84 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  26.84 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  27.75 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  27.88 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  29.09 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  26.84 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  26.42 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  29.09 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36420  uncharacterized membrane-associated protein  36.09 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.609148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  30.83 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  28.8 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.86 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  27.89 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  31.74 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  26.86 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  26.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  25.77 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  30.63 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  31.06 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  32.21 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  27.74 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  27.4 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  29.82 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  26.56 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.37 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  30.23 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  27.1 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.55 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  24.42 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  28.12 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  35.58 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  35.58 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  28.48 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  26.42 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  35.58 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  35.58 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  26.54 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  28.35 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  33.33 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  29.34 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  26.39 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0201  SNARE associated Golgi protein  28.78 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>