More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0141 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  100 
 
 		 478 aa  889    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  93.23 
 
 		 445 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  52.83 
 
 		 414 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  52.96 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  52.96 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  52.96 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  51.48 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  49.28 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 430 aa  173  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  42.04 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  35.68 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 465 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.37 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  32.85 
 
 		 424 aa  95.1  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  26.27 
 
 		 431 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 474 aa  93.6  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 410 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 440 aa  88.6  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  23.48 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 422 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2172  major facilitator superfamily MFS_1  54.87 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  hitchhiker  0.0000450319 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.82 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  27.47 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.83 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.51 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.16 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  22.6 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  28.65 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.34 
 
 		 1816 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.64 
 
 		 1833 aa  79  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.28 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33.65 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.36 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.83 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.29 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  22.92 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 412 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.03 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.03 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  28.88 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>