More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0140 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0140  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 		 416 aa  801    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0134  phosphoribosylamine--glycine ligase  91.11 
 
 		 416 aa  713    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.415315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0279  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.55 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0197  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.89 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6145  phosphoribosylamine/glycine ligase  65.61 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0170  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.97 
 
 		 420 aa  478  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.133071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3013  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.52 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0386  Phosphoribosylamine--glycine ligase  66.01 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.01 
 
 		 419 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38170  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.57 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3600  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.37 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.09 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4774  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.76 
 
 		 421 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4636  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.65 
 
 		 416 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728715  normal  0.385617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10787  phosphoribosylamine--glycine ligase  60.99 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1608  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.71 
 
 		 427 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  58.39 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4954  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.65 
 
 		 422 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0831  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.77 
 
 		 417 aa  448  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0251625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4571  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.65 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.840997  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4659  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.65 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0824941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4342  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.72 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5132  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.25 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3187  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.65 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2127  phosphoribosylamine--glycine ligase  63.96 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18510  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.98 
 
 		 429 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.25 
 
 		 446 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5150  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.09 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2960  phosphoribosylamine/glycine ligase  63.02 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3134  phosphoribosylamine/glycine ligase  61.36 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.808887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3626  phosphoribosylamine/glycine ligase  60.19 
 
 		 411 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.241782  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23300  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.17 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4370  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.11 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.766514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05830  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.98 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.822028  normal  0.495847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0208  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.48 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4100  phosphoribosylamine--glycine ligase  61.06 
 
 		 404 aa  362  9e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.27 
 
 		 423 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.46 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 		 422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.64 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0946  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.32 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0719  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.94 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.63678  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.63 
 
 		 427 aa  335  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.88 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0991  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 		 425 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0172  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.61 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.04 
 
 		 425 aa  329  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4544  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.36 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.39 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.39 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.27 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.42 
 
 		 432 aa  326  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 		 421 aa  326  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  46.9 
 
 		 433 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.34 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.55 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0535  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.68 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 427 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.02 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0635  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.13 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.33 
 
 		 422 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0619  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.28 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.374111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.1 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.55 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.97 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.85 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.22 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.15 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 		 422 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.06 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.05 
 
 		 704 aa  316  6e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.33 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.11 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.81 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.05 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.17 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.05 
 
 		 419 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.93 
 
 		 435 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.16 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.16 
 
 		 430 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6598  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.59 
 
 		 423 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.52 
 
 		 426 aa  312  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.39 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  44 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3302  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.98 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  49.48 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3175  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.57 
 
 		 418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.25 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.6 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4029  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.26 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.88 
 
 		 433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.45 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.5 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.81 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.82 
 
 		 430 aa  308  8e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  43.33 
 
 		 430 aa  308  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.48 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>