33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0136 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0136  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  283  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  decreased coverage  0.0000229934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0131  hypothetical protein  95.07 
 
 
163 aa  249  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.703605  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0177  hypothetical protein  64.49 
 
 
146 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6396  hypothetical protein  68.84 
 
 
135 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4634  hypothetical protein  62.32 
 
 
138 aa  159  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.35504  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0390  hypothetical protein  59.42 
 
 
140 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0212  hypothetical protein  62.59 
 
 
142 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.353762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4781  hypothetical protein  63.43 
 
 
135 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10365  hypothetical protein  58.16 
 
 
145 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.75723  normal  0.548031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0659  hypothetical protein  52.52 
 
 
139 aa  138  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4121  hypothetical protein  57.64 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.030665  normal  0.854224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0519  hypothetical protein  51.08 
 
 
140 aa  135  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38230  hypothetical protein  61.03 
 
 
137 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451635  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6915  hypothetical protein  57.78 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02110  hypothetical protein  52.17 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4367  hypothetical protein  60.58 
 
 
154 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0204  hypothetical protein  59.29 
 
 
139 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3011  hypothetical protein  63.04 
 
 
138 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.545636  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0494  hypothetical protein  68 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0516  hypothetical protein  68 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0505  hypothetical protein  68 
 
 
151 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4061  hypothetical protein  62.14 
 
 
146 aa  124  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.556763  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0514  hypothetical protein  55.64 
 
 
139 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.613231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05660  hypothetical protein  58.02 
 
 
149 aa  121  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.364936  normal  0.47448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0232  hypothetical protein  68.48 
 
 
141 aa  120  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5140  hypothetical protein  54.96 
 
 
135 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0672  hypothetical protein  67.82 
 
 
138 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4348  hypothetical protein  49.64 
 
 
160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.858908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6133  hypothetical protein  70.13 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35170  hypothetical protein  51.08 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08910  hypothetical protein  48.41 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.249276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2964  hypothetical protein  54.48 
 
 
138 aa  104  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220708  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3636  putative cytoplasmic protein  51.06 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.400267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>