More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0131 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 125 aa  248  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  96.8 
 
 		 125 aa  241  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  83.19 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  67.24 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  60 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  62.14 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  62.22 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  69.88 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 125 aa  120  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  59.79 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  64.63 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  61 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  58.24 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  57.14 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  54.46 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  52.53 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  50.5 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  51.35 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  51.43 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  58.06 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  55.91 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.08 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  58.54 
 
 		 183 aa  105  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  46.36 
 
 		 336 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  50.51 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  63.41 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  53.12 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  54.26 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  56.96 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  55.17 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  51 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  54.43 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  47.31 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  51.09 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 337 aa  91.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  50.63 
 
 		 347 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  48.81 
 
 		 349 aa  89.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 68 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  56 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 337 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  40.59 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 341 aa  80.5  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  42.2 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  50 
 
 		 341 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  47.73 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  48.24 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  40.96 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  46.59 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  52.17 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  41.41 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  42.86 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  37.65 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5146  ArsR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.426195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  47.22 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  52.63 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  34.69 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  45.21 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  33.7 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>