226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0096 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
249 aa  492  1e-138  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  88.35 
 
 
255 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  59.13 
 
 
254 aa  285  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  59.44 
 
 
251 aa  281  7e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  58.06 
 
 
254 aa  278  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  59.68 
 
 
252 aa  272  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  60.89 
 
 
254 aa  272  5e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  57.83 
 
 
301 aa  269  3e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  61.29 
 
 
250 aa  268  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 
252 aa  262  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  53.82 
 
 
254 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.06 
 
 
253 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
256 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  53.33 
 
 
258 aa  252  4e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 
252 aa  252  5e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 
251 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
253 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  54.03 
 
 
264 aa  245  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  53.63 
 
 
249 aa  243  2e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 
254 aa  243  2e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  56.05 
 
 
249 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
255 aa  241  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  56.45 
 
 
304 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 
254 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52.42 
 
 
255 aa  239  3e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 
252 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  53.82 
 
 
252 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
254 aa  235  5e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  56.63 
 
 
255 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  52.23 
 
 
257 aa  233  2e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
255 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  53.6 
 
 
299 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  50.4 
 
 
252 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  54.88 
 
 
255 aa  225  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
250 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.44 
 
 
255 aa  222  5e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
258 aa  220  2e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 
250 aa  218  8e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
250 aa  215  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 
255 aa  213  2e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 
260 aa  210  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
257 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 
254 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  44.4 
 
 
255 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
255 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
273 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 
274 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  44.98 
 
 
255 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 
262 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 
254 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.9 
 
 
255 aa  201  7e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 
250 aa  200  2e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
259 aa  199  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
259 aa  200  2e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 
255 aa  200  2e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  40.41 
 
 
255 aa  199  4e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
256 aa  197  1e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.63 
 
 
253 aa  197  1e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  39.59 
 
 
255 aa  197  1e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  43.37 
 
 
256 aa  197  1e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  43.59 
 
 
252 aa  197  1e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 
256 aa  196  2e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  47.58 
 
 
254 aa  196  2e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 
255 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  43.78 
 
 
256 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  47.28 
 
 
247 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  45.19 
 
 
259 aa  195  5e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  45.19 
 
 
251 aa  195  5e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
254 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 
258 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  41.46 
 
 
254 aa  194  9e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  45.78 
 
 
255 aa  194  9e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  45.42 
 
 
251 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  40.32 
 
 
256 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  42.39 
 
 
251 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 
258 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06420  hypothetical protein  43.95 
 
 
252 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  44.35 
 
 
261 aa  192  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
247 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
250 aa  191  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
250 aa  191  8e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 
250 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  46.41 
 
 
250 aa  191  9e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  46 
 
 
270 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  44.08 
 
 
250 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  39.11 
 
 
257 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4034  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 
253 aa  190  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
260 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  40.24 
 
 
253 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  44.77 
 
 
250 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  40.24 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  44.53 
 
 
252 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  44.94 
 
 
251 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  39.84 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  42.17 
 
 
256 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0595  hypothetical protein  43.95 
 
 
252 aa  189  3e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.27 
 
 
254 aa  189  3e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>