15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0091 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  304  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  90.51 
 
 		 158 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  52.26 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  51.2 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  52.26 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  43.45 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  44.74 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  43.75 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  57.89 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  36.91 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  32.9 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  34.23 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  43.69 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  28.39 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>