More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0084 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  100 
 
 
213 aa  410  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  74.65 
 
 
241 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  50.6 
 
 
257 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
179 aa  129  4e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  61.46 
 
 
239 aa  126  2e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  6.83407e-08  decreased coverage  4.39992e-07 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
233 aa  118  5e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  55.66 
 
 
127 aa  114  1e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  59.55 
 
 
181 aa  110  2e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  60.47 
 
 
119 aa  108  4e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  63.53 
 
 
114 aa  108  8e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
167 aa  107  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
163 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  55.1 
 
 
153 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
118 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  59.77 
 
 
124 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  49.53 
 
 
127 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
144 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  59.76 
 
 
124 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  45.59 
 
 
371 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
120 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  58.14 
 
 
238 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
124 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  44.36 
 
 
239 aa  101  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
129 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
120 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
163 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
140 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  59.04 
 
 
116 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  55 
 
 
124 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  1.79293e-08 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  48.18 
 
 
165 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
124 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
137 aa  99.4  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  55.68 
 
 
170 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  61.04 
 
 
117 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
137 aa  99  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  50.46 
 
 
342 aa  99  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  67.69 
 
 
115 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  49.41 
 
 
118 aa  98.6  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
134 aa  98.2  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  49.41 
 
 
118 aa  98.6  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  64.62 
 
 
115 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  50 
 
 
118 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  64.62 
 
 
115 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
137 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
137 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
137 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
124 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  61.25 
 
 
122 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  46.79 
 
 
367 aa  96.3  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  60.67 
 
 
142 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  45.71 
 
 
131 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  52.78 
 
 
139 aa  95.5  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
360 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
360 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
131 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
270 aa  95.1  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  44.59 
 
 
322 aa  95.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  39.53 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  48.96 
 
 
157 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  39.53 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  39.53 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
168 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  57.3 
 
 
125 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  57.3 
 
 
125 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
147 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  45.6 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
121 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
155 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  38.51 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
124 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  52.13 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.20345e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  42.28 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  51.58 
 
 
122 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  64.29 
 
 
94 aa  92.8  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  42.06 
 
 
279 aa  92  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  55.06 
 
 
123 aa  92  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
199 aa  92  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  49.41 
 
 
124 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  46.43 
 
 
321 aa  91.7  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.68198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  60.71 
 
 
261 aa  91.7  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  7.77021e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
163 aa  91.7  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
145 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
262 aa  91.3  9e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  45.13 
 
 
150 aa  91.3  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  50.85 
 
 
162 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  45.76 
 
 
171 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  62.86 
 
 
121 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  41.72 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  36.65 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
358 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  62.32 
 
 
121 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  56.96 
 
 
122 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
335 aa  90.1  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  47.57 
 
 
162 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
370 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  51 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
133 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>