More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0073 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 110 aa  227  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  59.41 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  60.78 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  59.18 
 
 		 355 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  56.31 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  44.21 
 
 		 302 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1071  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  35 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  34.31 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  34.88 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1247  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  37.84 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0561  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2272  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0649616  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  39.74 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4060  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  40.51 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2838  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.221862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4498  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  39.24 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3234  regulatory protein, ArsR  44.12 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  38.81 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0754  transcriptional regulator, ArsR family  36.76 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.0266624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  35.56 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  33.78 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  37.8 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3407  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2324  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  42.03 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  34 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  41.27 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  32 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  32.14 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  42.03 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.02 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  42.19 
 
 		 307 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1115  transcriptional regulator, ArsR family  38.24 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4565  transcriptional regulator, ArsR family  32.39 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  37.88 
 
 		 306 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3094  ArsR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3194  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3288  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0616099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2048  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1024  ArsR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1086  transcriptional regulator, ArsR family  49.12 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  34.48 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  26.09 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  27.16 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  41.27 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>