29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0066 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0066  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6038  hypothetical protein  31.67 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  35.56 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  36.02 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.42 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  30.86 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  29.61 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8261  hypothetical protein  29.19 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0410012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1894  hypothetical protein  26.97 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  30 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  31.87 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14500  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.55 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.111122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2560  protein of unknown function DUF1470  30.1 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  32.04 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  32.04 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  29.59 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3324  hypothetical protein  23.76 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4029  hypothetical protein  29.44 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  31.31 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  31.9 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  29.26 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6461  hypothetical protein  29.15 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0507888  normal  0.43229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  27.09 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1464  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  25.36 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  25.36 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  29.07 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  25.5 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  30 
 
 		 200 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>