More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0060 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  100 
 
 
337 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  83.09 
 
 
337 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.22 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.54 
 
 
340 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  32.78 
 
 
333 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  33.55 
 
 
323 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  34.07 
 
 
331 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  32.25 
 
 
323 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.13 
 
 
327 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  33.79 
 
 
306 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  33.12 
 
 
323 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  33.93 
 
 
342 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  52.54 
 
 
417 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  53.85 
 
 
459 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  30.15 
 
 
334 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.91 
 
 
350 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  37.28 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  32.2 
 
 
333 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  34.12 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  32.13 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  31.35 
 
 
319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  54.13 
 
 
350 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  51.75 
 
 
332 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  40.54 
 
 
531 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  29.38 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  27.08 
 
 
348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  44.64 
 
 
452 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.83 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  41.1 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
345 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.84 
 
 
330 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.52 
 
 
235 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2096  NLP/P60 protein  29.7 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.685486  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  47.32 
 
 
432 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  47.06 
 
 
162 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  45.79 
 
 
347 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  46.43 
 
 
432 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  29.39 
 
 
343 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  27.2 
 
 
373 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  28.68 
 
 
301 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  46.61 
 
 
349 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.3 
 
 
329 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  40.5 
 
 
453 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  42.19 
 
 
458 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  48.31 
 
 
281 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
392 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
378 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  38.22 
 
 
348 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  41.82 
 
 
372 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
372 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  40.52 
 
 
378 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  41.82 
 
 
372 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  42.5 
 
 
501 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  48.51 
 
 
286 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.86 
 
 
388 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  50.5 
 
 
337 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  44.44 
 
 
400 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  45.71 
 
 
398 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  43.64 
 
 
368 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
347 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  48.31 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  36.81 
 
 
475 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  36.81 
 
 
475 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  36.81 
 
 
475 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  44.35 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  36.75 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  35.76 
 
 
524 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  36.3 
 
 
478 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.92 
 
 
236 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
472 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  44.33 
 
 
491 aa  96.3  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  46.73 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.52 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  34.73 
 
 
467 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  36.57 
 
 
469 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  47.57 
 
 
222 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  40 
 
 
517 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.23 
 
 
176 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  33.33 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  40.34 
 
 
467 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  40.34 
 
 
467 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  36.43 
 
 
479 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  43.41 
 
 
177 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
116 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  39.82 
 
 
363 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  41.28 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  38.6 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  48.24 
 
 
274 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  46.08 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  39.5 
 
 
472 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  40.37 
 
 
348 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  40 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  48.45 
 
 
297 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.8 
 
 
390 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40 
 
 
230 aa  93.6  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  43.4 
 
 
256 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
432 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>