89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0056 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  100 
 
 
556 aa  1089  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  64.73 
 
 
521 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  40.51 
 
 
262 aa  180  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  41.26 
 
 
312 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  43.95 
 
 
249 aa  173  6e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  42.27 
 
 
268 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  41.18 
 
 
323 aa  167  6e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  42.79 
 
 
234 aa  164  4e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  39 
 
 
192 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  41.28 
 
 
218 aa  147  4e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  37.24 
 
 
276 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  38.29 
 
 
238 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  36.86 
 
 
266 aa  137  6e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  36.61 
 
 
412 aa  133  8e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  36.05 
 
 
238 aa  132  2e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  33.21 
 
 
298 aa  132  2e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  37.97 
 
 
270 aa  132  2e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  37.5 
 
 
229 aa  129  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  36.55 
 
 
243 aa  128  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  35.55 
 
 
353 aa  122  2e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  33.78 
 
 
260 aa  122  2e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84176e-11 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  35.65 
 
 
257 aa  119  2e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  34.51 
 
 
268 aa  115  1e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  37.22 
 
 
368 aa  114  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  33.74 
 
 
242 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  41.18 
 
 
251 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  36.13 
 
 
286 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  31.49 
 
 
236 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  32.86 
 
 
220 aa  80.1  1e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  28.99 
 
 
316 aa  80.1  1e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  32.86 
 
 
225 aa  80.1  1e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  33.61 
 
 
197 aa  70.9  5e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  28.5 
 
 
200 aa  69.7  1e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  37.5 
 
 
209 aa  64.3  5e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  37.8 
 
 
269 aa  63.2  1e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  40 
 
 
205 aa  62.4  2e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  32.18 
 
 
262 aa  62  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  34.31 
 
 
267 aa  62  3e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  29.23 
 
 
222 aa  61.6  4e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.68018e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  31.39 
 
 
187 aa  59.7  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  31.39 
 
 
187 aa  59.7  1e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  28.65 
 
 
307 aa  59.3  2e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  28.7 
 
 
251 aa  58.5  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  37.5 
 
 
270 aa  58.5  3e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  30.46 
 
 
244 aa  57.8  5e-07  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  23.64 
 
 
2449 aa  57.4  6e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  29.29 
 
 
269 aa  55.8  2e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  32.06 
 
 
324 aa  55.5  2e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30 
 
 
265 aa  55.8  2e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1626  sortase family protein  31.5 
 
 
208 aa  55.1  3e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.19 
 
 
206 aa  55.1  4e-06  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  30.49 
 
 
206 aa  55.1  4e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  30.19 
 
 
206 aa  54.7  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.38 
 
 
206 aa  54.3  6e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.49 
 
 
198 aa  54.3  6e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  35 
 
 
218 aa  53.9  7e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  32.06 
 
 
377 aa  53.5  9e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31719e-07 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  33.12 
 
 
233 aa  53.5  1e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.19 
 
 
206 aa  53.5  1e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.49 
 
 
206 aa  53.5  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.56 
 
 
206 aa  53.1  1e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  30.49 
 
 
206 aa  53.5  1e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1399  sortase family protein  32.14 
 
 
207 aa  53.5  1e-05  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  30.16 
 
 
270 aa  52.8  2e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  31.61 
 
 
236 aa  52  3e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  9.51258e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  33.33 
 
 
377 aa  51.6  4e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4847  sortase family protein  24.53 
 
 
202 aa  51.2  4e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  31.02 
 
 
199 aa  51.2  5e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  38.66 
 
 
298 aa  51.2  5e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2002  sortase (surface protein transpeptidase)-like protein  32.52 
 
 
214 aa  50.4  8e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.030888  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  30.49 
 
 
235 aa  50.4  9e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  29.53 
 
 
233 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  4.02223e-05 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  28.1 
 
 
250 aa  50.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  1.6214e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  26.24 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  27.66 
 
 
238 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  32.35 
 
 
238 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2447  sortase family protein  27.75 
 
 
234 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00927712  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  34.78 
 
 
302 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3683  sortase family protein  32.35 
 
 
195 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  32.06 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1740  sortase family protein  31.2 
 
 
204 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  25.87 
 
 
253 aa  48.9  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2151  sortase family protein  28.41 
 
 
196 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  0.211474 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  26.95 
 
 
247 aa  48.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  29.8 
 
 
328 aa  47.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1674  sortase family protein  32.37 
 
 
207 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  25.14 
 
 
327 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2199  sortase family protein  31.2 
 
 
229 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  31.2 
 
 
213 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>