199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0041 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  95.56 
 
 
293 aa  544  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  54.68 
 
 
283 aa  318  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  51.93 
 
 
287 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  51.44 
 
 
301 aa  281  8e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  49.12 
 
 
285 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  48.04 
 
 
282 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 
282 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  47 
 
 
291 aa  254  2e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  46.32 
 
 
283 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  45.91 
 
 
289 aa  244  2e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  45.85 
 
 
278 aa  238  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  44.32 
 
 
410 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  43.21 
 
 
291 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  45.26 
 
 
292 aa  235  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  43.01 
 
 
288 aa  233  2e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  44.24 
 
 
285 aa  233  2e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  41.84 
 
 
289 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  41.75 
 
 
287 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  42.09 
 
 
303 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  46.25 
 
 
288 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  44.32 
 
 
290 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  42.29 
 
 
291 aa  226  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  45.35 
 
 
292 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  41.55 
 
 
287 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  46.8 
 
 
288 aa  222  5e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 
280 aa  222  5e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  49.25 
 
 
278 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  45.23 
 
 
295 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  41.58 
 
 
288 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.09 
 
 
292 aa  218  9e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  46.12 
 
 
303 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  41.79 
 
 
296 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  43.42 
 
 
284 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  44.96 
 
 
296 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  48.13 
 
 
278 aa  216  3e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  2.27824e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  45.59 
 
 
280 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 
291 aa  213  4e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  41.82 
 
 
294 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  43.49 
 
 
295 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  43.45 
 
 
296 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  43.4 
 
 
290 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  40.21 
 
 
284 aa  208  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  44.53 
 
 
300 aa  208  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.21562e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  47.13 
 
 
301 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  40.6 
 
 
281 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  4.84081e-08 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  43.4 
 
 
302 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  44.19 
 
 
299 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  42.35 
 
 
288 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  40.36 
 
 
287 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.65 
 
 
279 aa  201  1e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  36.18 
 
 
328 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  41.58 
 
 
287 aa  198  8e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  42.2 
 
 
308 aa  197  2e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  40.57 
 
 
285 aa  197  2e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 
276 aa  197  2e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 
278 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 
310 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  40.36 
 
 
281 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.01 
 
 
284 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  41.49 
 
 
285 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  38.85 
 
 
285 aa  190  3e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.41 
 
 
278 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.6 
 
 
283 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 
287 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  38.38 
 
 
295 aa  185  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  41.48 
 
 
301 aa  184  1e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  41.25 
 
 
270 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  36.82 
 
 
284 aa  180  3e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  42.18 
 
 
290 aa  174  1e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
282 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.22 
 
 
281 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  39.69 
 
 
293 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  39.76 
 
 
319 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  36.65 
 
 
285 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  37.05 
 
 
286 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  37.81 
 
 
293 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 
282 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  37.46 
 
 
293 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  36.52 
 
 
294 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  40.66 
 
 
302 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 
279 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  41.32 
 
 
276 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  36.71 
 
 
297 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  37.41 
 
 
284 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  34.15 
 
 
293 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  36.2 
 
 
286 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  37.23 
 
 
281 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  39.31 
 
 
274 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 
286 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  34.63 
 
 
306 aa  153  3e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  37.72 
 
 
290 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  34.77 
 
 
293 aa  147  1e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4415  helix-turn-helix domain-containing protein  31.39 
 
 
283 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.27 
 
 
290 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  36.3 
 
 
326 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0264  helix-turn-helix domain protein  33.67 
 
 
314 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0859021  normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  32.38 
 
 
284 aa  141  1e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  35.5 
 
 
262 aa  141  1e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>