41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0025 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 139 aa  273  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  82.73 
 
 		 142 aa  234  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  48.92 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  49.26 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  45.65 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  47.59 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  47.76 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  48.15 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  51.13 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  47.79 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  46.62 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  47.79 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  47.79 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  46.32 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  46.76 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  48.89 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  41.78 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  50.38 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  44.52 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  41.43 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  41.26 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  43.48 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  41.01 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  42.98 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3953  Fe-S metabolism associated SufE  27.41 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  34.03 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  25.4 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  27.93 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4443  Fe-S metabolism associated SufE  24.63 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2026  Fe-S metabolism associated SufE  27.68 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.908248  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08891  hypothetical protein  27.87 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7639  predicted protein  25.83 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  27.56 
 
 		 136 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5783  Fe-S metabolism associated SufE  26.8 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.131653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  24.55 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1956  SufE protein  28.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3475  cysteine desulfuration protein SufE  26.61 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00677521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0163  Fe-S metabolism associated SufE  28.57 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000342799  unclonable  8.26296e-16 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28143  predicted protein  27.27 
 
 		 579 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.138283  normal  0.0426817 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00356  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  26.42 
 
 		 145 aa  40  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.118758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>