More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0019 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 876 aa  1095    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 862 aa  1756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 911 aa  955    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 845 aa  1101    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 		 881 aa  1124    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  54.93 
 
 		 925 aa  944    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  58.18 
 
 		 872 aa  1012    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 		 877 aa  1038    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  64.81 
 
 		 903 aa  1097    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 		 894 aa  1007    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  58.74 
 
 		 885 aa  996    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  61.66 
 
 		 906 aa  1063    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  60.72 
 
 		 916 aa  1037    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  88.75 
 
 		 860 aa  1540    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.86 
 
 		 836 aa  1113    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  58.9 
 
 		 895 aa  1025    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  62.24 
 
 		 861 aa  1063    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 855 aa  889    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  62.19 
 
 		 886 aa  1058    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 873 aa  1010    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66 
 
 		 846 aa  1108    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 		 871 aa  1014    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 902 aa  1050    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.2 
 
 		 858 aa  1078    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 		 901 aa  1032    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 864 aa  591  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 802 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 808 aa  580  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 896 aa  498  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 928 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 908 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 905 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 892 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 886 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 864 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 886 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 886 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 906 aa  421  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 863 aa  416  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 855 aa  416  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 809 aa  413  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 869 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 865 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 865 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 865 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 863 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 886 aa  403  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 858 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 799 aa  366  1e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 799 aa  363  6e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 799 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 799 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 806 aa  355  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  29.51 
 
 		 808 aa  355  2e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 		 771 aa  352  2e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 816 aa  348  2e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 877 aa  348  4e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 881 aa  290  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 882 aa  290  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 880 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 882 aa  288  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 885 aa  285  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 926 aa  279  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 881 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 881 aa  278  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 911 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 		 891 aa  275  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  26.73 
 
 		 881 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 881 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 		 902 aa  273  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 881 aa  273  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 881 aa  273  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 883 aa  273  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  29.43 
 
 		 882 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  26.61 
 
 		 881 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 881 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 883 aa  271  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.15 
 
 		 872 aa  271  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  26.04 
 
 		 881 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 881 aa  269  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 893 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0722  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 		 895 aa  269  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 881 aa  269  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 872 aa  269  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 881 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  26.37 
 
 		 881 aa  269  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 883 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 883 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 930 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.39 
 
 		 909 aa  268  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  29.16 
 
 		 861 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5159  valyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 906 aa  267  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.174874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 883 aa  266  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 883 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 1002 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2652  valyl-tRNA synthetase  28.96 
 
 		 854 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.45272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 922 aa  264  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 879 aa  265  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0367  valyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 907 aa  264  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.159173  normal  0.186689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>