More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3588 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 322 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  78.57 
 
 		 318 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  77.88 
 
 		 346 aa  498  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  78.57 
 
 		 318 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  78.57 
 
 		 318 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  78.57 
 
 		 318 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  79.14 
 
 		 346 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  79.14 
 
 		 346 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  74.13 
 
 		 317 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  66.89 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  66.22 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  60.78 
 
 		 322 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  60.73 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  60.46 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  58.31 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.13 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  57.14 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  58.14 
 
 		 308 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  56.17 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  56.39 
 
 		 315 aa  328  8e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  45.93 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  44.79 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  44.7 
 
 		 311 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  45.87 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.07 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  44.19 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  44.63 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  45.03 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  43.04 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  43.85 
 
 		 313 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  45 
 
 		 317 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  44.01 
 
 		 318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  44.27 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  43.55 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  41.9 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  44.97 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  43.92 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  41.5 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  44.48 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  43.81 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  44.67 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.89 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  42.71 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  43.83 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  41.31 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  42.37 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  45.38 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  43.81 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  45.3 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  43.48 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  49.54 
 
 		 512 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  46.35 
 
 		 580 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  39.47 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  48.68 
 
 		 510 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  46.28 
 
 		 576 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  46.86 
 
 		 579 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  49.77 
 
 		 317 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  39.13 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  50.23 
 
 		 582 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  39.67 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  49.31 
 
 		 576 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  43.87 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.92 
 
 		 580 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.01 
 
 		 667 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.79 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  48.23 
 
 		 593 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  49.79 
 
 		 580 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 580 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  49.32 
 
 		 582 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  47.32 
 
 		 580 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  50.69 
 
 		 581 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  40.92 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  38.8 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  48.39 
 
 		 583 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  47.98 
 
 		 578 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  48.05 
 
 		 912 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  47.6 
 
 		 909 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>