More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3573 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 284 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  63.25 
 
 		 280 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  64.54 
 
 		 287 aa  360  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  63.83 
 
 		 287 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  62.37 
 
 		 280 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  63.83 
 
 		 287 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  64.29 
 
 		 287 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  62.54 
 
 		 287 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  63.57 
 
 		 287 aa  353  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  63.57 
 
 		 287 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  63.21 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  63.21 
 
 		 287 aa  351  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  62.95 
 
 		 280 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  60.78 
 
 		 283 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  60.35 
 
 		 289 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  37.85 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  37.2 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  33.07 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  32.68 
 
 		 290 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  33.07 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  32.28 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  39.91 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  33.94 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  33.93 
 
 		 288 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  33.77 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.93 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  32.43 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  33.49 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  34.12 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.78 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  33.49 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  31.08 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.32 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  28.07 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  35.37 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  36.94 
 
 		 300 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  31.94 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  29.78 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.1 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  32.58 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  29.95 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  33.94 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  29.27 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  32.08 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.32 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  28.57 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  30.86 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  35.55 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  34.7 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  28.57 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  30.87 
 
 		 273 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.33 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  36.99 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  32.39 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  28.81 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  33.2 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  35.16 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  33.2 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  35.93 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  36.99 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  27.27 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  38.39 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  35.06 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  35.85 
 
 		 914 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  35 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  35 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  35 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  36.74 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0849  ABC transporter related  32.23 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  36.09 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.87 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  34.06 
 
 		 932 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  33.33 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0539  ABC transporter related  29.48 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000208242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  30.74 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>