158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3570 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  273  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  77.42 
 
 		 134 aa  200  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  72.09 
 
 		 134 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  73.39 
 
 		 135 aa  197  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  72.44 
 
 		 136 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 		 136 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  72.44 
 
 		 136 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 		 136 aa  193  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  71.65 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  70.87 
 
 		 136 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  68 
 
 		 155 aa  183  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  66.93 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  66.94 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  51.56 
 
 		 133 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  50 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  43.85 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  45.6 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  45.6 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  45.6 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  43.09 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  42.52 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  43.2 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  29.69 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.8 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 133 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  23.39 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.8 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.8 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  29.03 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 283 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  27.64 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  24.19 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.64 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.19 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  27.78 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  24.41 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  25.89 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  26.98 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  24.6 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  24.78 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  25.41 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  28.57 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>