More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3541 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  100 
 
 		 297 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  64.58 
 
 		 307 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  64.24 
 
 		 307 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  63.89 
 
 		 307 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  65.85 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  63.89 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  65.51 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  65.16 
 
 		 307 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  62.85 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  56.12 
 
 		 313 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  55.67 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  53.02 
 
 		 332 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  52.86 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  52.41 
 
 		 313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  51.56 
 
 		 301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  48.74 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  39.81 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  44.36 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  42.14 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  40.96 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  40.33 
 
 		 329 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  39.93 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  40.39 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  41.22 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  40.5 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  40.26 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  39.74 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  37.87 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  40.33 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  39.73 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  39.73 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  37.05 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  37.83 
 
 		 329 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  40.96 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  40.55 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  38.36 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  41.99 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  38.01 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  37.87 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  39.15 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  39.04 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  37.93 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  38.13 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  32.59 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  38.38 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  39.07 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  38.15 
 
 		 310 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  38.38 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  36.81 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  36.59 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  35.02 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  38.71 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  36.3 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  34.2 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  37.41 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  38.73 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  38.01 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  37.99 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  37.99 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  36.92 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  39.44 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  37.99 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  37.86 
 
 		 306 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  38.38 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  36.3 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  38.38 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  38.03 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  38.01 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  38.38 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  34.23 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  37.63 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  37.78 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  36.47 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  38.38 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  36.47 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  37.36 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  36.65 
 
 		 313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  37.73 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  38.03 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.63 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  35.94 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  36.97 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  35.69 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  38.38 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  37.41 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  37.32 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  36.16 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  37.86 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  37.27 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  37.33 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  36.92 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  36.92 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  32.5 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  35.29 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  35.07 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  36.2 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  38.6 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  38.29 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>