More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3530 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  79.56 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80 
 
 		 226 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  80 
 
 		 226 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.33 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.33 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.33 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  79.56 
 
 		 226 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  77.33 
 
 		 226 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.89 
 
 		 226 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.21 
 
 		 226 aa  348  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.02 
 
 		 226 aa  345  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  76.26 
 
 		 226 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  73.78 
 
 		 226 aa  342  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4396  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  74.21 
 
 		 226 aa  328  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00827136  hitchhiker  0.0000786314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0106  molybdate ABC transporter permease  72.35 
 
 		 223 aa  322  4e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0139965  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  65.78 
 
 		 226 aa  289  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0836  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  56.56 
 
 		 222 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  54.79 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0162  molybdate ABC transporter permease  55.98 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.171258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0782  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.39 
 
 		 217 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.69 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2343  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.62 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2242  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3142  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.4 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0359  molybdate ABC transporter, permease protein  41.36 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.26 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0453  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.06 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.761229 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1717  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.712686  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0925  molybdate ABC transporter permease  44.75 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00103701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0313  molybdate ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0323  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.07 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0346  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.290442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.06 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1710  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.59 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145682 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0372  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.12 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3125  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.35 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2282  molybdate ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2165  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.11 
 
 		 232 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0999  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.01 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1877  molybdate ABC transporter inner membrane protein  43.78 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1926  molybdate ABC transporter permease  43.66 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1573  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.41 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  hitchhiker  0.00449794 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1057  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0250  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.61 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1519  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.79 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.046514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  40.57 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1060  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.94 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 		 230 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03850  molybdenum ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  42.29 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0942  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000896447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4640  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.06 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.242553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2153  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.35 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.70472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0581  molybdate ABC transporter, permease protein  40.51 
 
 		 221 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  44.62 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0705  molybdate ABC transporter permease  42.47 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.05 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.93 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  42.2 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0451  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.03 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0434  molybdate ABC transporter permease protein  37.5 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0177923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1628  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.18 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.65 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.305104  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  39.57 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0618  ABC molybdenum transporter, inner membrane subunit ModB  41.1 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0339  molybdate ABC transporter permease protein  38.39 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.301982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2942  molybdate ABC transporter permease  39.19 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1284  molybdate ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2040  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.36 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2732  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2887  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0388604  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1379  molybdenum ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.521789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1571  molybdenum ABC transporter, permease protein (ModB)  42.56 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.602024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2846  ABC-type molybdate transport system permease component-like  40.76 
 
 		 537 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.755447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  41.36 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.54 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000118  molybdenum transport system permease protein ModB  36.2 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.479773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2079  molybdenum ABC transporter permease protein  38.64 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0537  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  41 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.62 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  36.7 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  36.45 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  34.84 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0858  molybdate ABC transporter permease  38.79 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3428  molybdenum transporter  43.96 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40410  molybdenum transport protein ModB  43.41 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>