184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3520 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4123  MOSC domain-containing protein  61.19 
 
 
232 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0281  MOSC domain-containing protein  57.02 
 
 
231 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0277  MOSC domain containing protein  57.02 
 
 
237 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0273  MOSC domain-containing protein  57.02 
 
 
231 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0270  MOSC domain-containing protein  55.7 
 
 
231 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112146  hitchhiker  0.00000109327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0269  MOSC domain-containing protein  55.7 
 
 
231 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.480151  hitchhiker  0.0000407513 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3752  MOSC domain-containing protein  55.7 
 
 
231 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4406  MOSC domain-containing protein  55.75 
 
 
232 aa  263  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0712401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  55.02 
 
 
232 aa  262  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0280  MOSC domain-containing protein  56.89 
 
 
229 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.077384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0385  MOSC domain-containing protein  55.7 
 
 
231 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4456  hypothetical protein  53.51 
 
 
231 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0083  MOSC domain-containing protein  54.75 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0145195  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0078  MOSC domain-containing protein  55.16 
 
 
230 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4342  hypothetical protein  46.38 
 
 
229 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000280654 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4386  hypothetical protein  46.38 
 
 
229 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4454  hypothetical protein  46.38 
 
 
229 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4302  hypothetical protein  46.38 
 
 
229 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4273  hypothetical protein  45.89 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.833084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0630  hypothetical protein  41.7 
 
 
233 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4444  hypothetical protein  45.1 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0079  hypothetical protein  42.01 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  41.7 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5365  hypothetical protein  45.1 
 
 
224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326759  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03796  hypothetical protein  44.61 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4074  MOSC domain containing protein  44.61 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4107  hypothetical protein  44.61 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03745  hypothetical protein  44.61 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4141  hypothetical protein  44.61 
 
 
224 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4390  hypothetical protein  44.61 
 
 
224 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4303  hypothetical protein  44.61 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.445001  hitchhiker  0.00595644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4062  hypothetical protein  42.65 
 
 
224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00109067  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4906  MOSC domain-containing protein  34.26 
 
 
227 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  40.28 
 
 
226 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  38.73 
 
 
242 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  39.13 
 
 
234 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  38.73 
 
 
242 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  42.03 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  38.16 
 
 
235 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  37.12 
 
 
250 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4809  MOSC domain containing protein  41.15 
 
 
227 aa  151  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.359001 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  38.65 
 
 
234 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  38.65 
 
 
234 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  38.16 
 
 
234 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1485  hypothetical protein  36.22 
 
 
232 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0104541  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  38.39 
 
 
226 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  38.65 
 
 
234 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  40.1 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  36.06 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  37.75 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0998  MOSC domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.759805  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1959  MOSC domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0955  MOSC domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0870  MOSC domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0278  MOSC domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0356222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1005  MOSC domain-containing protein  37.7 
 
 
229 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  37.5 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1159  MOSC domain-containing protein  38.38 
 
 
229 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  35.81 
 
 
235 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  38.35 
 
 
234 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  36.84 
 
 
235 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3061  MOSC domain-containing protein  35.24 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068485  normal  0.778276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  39.02 
 
 
234 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0036  MOSC  38.46 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0802  MOSC domain-containing protein  35.75 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  37.25 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  38.65 
 
 
229 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  34.12 
 
 
241 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4660  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 
220 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.287736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  36.4 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2076  hypothetical protein  34.06 
 
 
228 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001034  hypothetical protein  38.86 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.907247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  36.27 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  39.66 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  35.61 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  35.61 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  35.61 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  35.61 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  35.61 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  37.11 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  35.12 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  34.63 
 
 
229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4524  hypothetical protein  35.56 
 
 
215 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4566  hypothetical protein  35.56 
 
 
215 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0684  hypothetical protein  36.11 
 
 
215 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  36.19 
 
 
242 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  35.15 
 
 
215 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4279  MOSC domain-containing protein  36.11 
 
 
215 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4551  hypothetical protein  35.56 
 
 
215 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00426926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4167  MOSC domain-containing protein  35 
 
 
215 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1855  mosc domain-containing protein  34.69 
 
 
229 aa  122  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 
229 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  34.15 
 
 
229 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4513  hypothetical protein  35 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.405643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  33.66 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2441  MOSC domain containing protein  34.12 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12104  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4330  hypothetical protein  34.44 
 
 
215 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4665  hypothetical protein  34.44 
 
 
215 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0210  MOSC domain containing protein  35.1 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>