More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3492 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  52.36 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  53.52 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  55.33 
 
 		 218 aa  225  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  51.18 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  51.18 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  51.18 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  51.18 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  50.97 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  49.51 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  49.51 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  49.29 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  47.87 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  48.54 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  55.31 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  51.76 
 
 		 204 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  45.03 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  43.33 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  40.59 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  44.52 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  41.03 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  38.12 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  39.18 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  38.6 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  40.68 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  36.73 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.55 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  37.24 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  39.46 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.85 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  37.24 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  32.8 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  39.02 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  32.16 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  46.55 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  34.76 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  32.68 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.92 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  40.6 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  33.54 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  42.75 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  33.13 
 
 		 291 aa  104  9e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  35.8 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  29.29 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  39.37 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  31.15 
 
 		 287 aa  101  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  34.36 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  39.38 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  38.19 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  35.03 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  37.09 
 
 		 246 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  41.38 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  28.43 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  36.02 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.95 
 
 		 198 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  35.42 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  32.67 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3279  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  35.84 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  31.49 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  37.31 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  31.07 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  34.04 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  31.13 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  33.11 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  30.06 
 
 		 220 aa  92  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  36.64 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  36.28 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  36.28 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  38.64 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  37.59 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  37.12 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>