More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3484 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3536  cytochrome-c oxidase  69.47 
 
 		 544 aa  732    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  80.66 
 
 		 529 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0543399  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0457  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0880  cytochrome c oxidase, subunit I  73.3 
 
 		 541 aa  810    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  68.29 
 
 		 534 aa  746    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3180  cytochrome-c oxidase  69.88 
 
 		 539 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.462772  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0235  cytochrome c oxidase, subunit I  83.02 
 
 		 540 aa  910    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  93.97 
 
 		 530 aa  1007    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2716  cytochrome c oxidase, subunit I CyoB  80.72 
 
 		 534 aa  878    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.308543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  64.78 
 
 		 550 aa  729    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001446  cytochrome c oxidase polypeptide I  89.25 
 
 		 543 aa  926    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0112  cytochrome c oxidase, subunit I  66.16 
 
 		 524 aa  720    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  69.28 
 
 		 543 aa  730    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2961  cytochrome c oxidase, subunit I  72.83 
 
 		 538 aa  812    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2810  cytochrome c oxidase, subunit I  73.02 
 
 		 538 aa  813    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1470  cytochrome c oxidase, subunit I  61.06 
 
 		 531 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  80.63 
 
 		 530 aa  859    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  80.08 
 
 		 527 aa  862    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0315  cytochrome-c oxidase  69.8 
 
 		 534 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  92.7 
 
 		 534 aa  990    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  73.65 
 
 		 526 aa  796    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  78.03 
 
 		 530 aa  862    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  69.56 
 
 		 543 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  93.07 
 
 		 534 aa  993    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0118  cytochrome c oxidase, subunit I  80.47 
 
 		 529 aa  860    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  68.66 
 
 		 535 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 531 aa  1068    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1593  cytochrome c oxidase polypeptide I  66.35 
 
 		 531 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3046  cytochrome c oxidase  67.56 
 
 		 532 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000491174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  79.3 
 
 		 530 aa  855    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  91.11 
 
 		 540 aa  994    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  80.38 
 
 		 527 aa  879    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  69.79 
 
 		 535 aa  741    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  87.71 
 
 		 546 aa  947    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  93.79 
 
 		 530 aa  1009    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3557  cytochrome-c oxidase  66.92 
 
 		 569 aa  710    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0159482  normal  0.969865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0311  cytochrome c oxidase, subunit I  69.36 
 
 		 535 aa  746    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  93.79 
 
 		 530 aa  1009    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  93.79 
 
 		 530 aa  1009    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0137  cytochrome c oxidase, subunit I  66.35 
 
 		 531 aa  723    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  69.04 
 
 		 534 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  73.67 
 
 		 526 aa  767    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  73.19 
 
 		 529 aa  783    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 		 535 aa  758    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  68.02 
 
 		 544 aa  718    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  69.79 
 
 		 535 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0120  cytochrome c oxidase, subunit I  80.86 
 
 		 529 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  66.91 
 
 		 537 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0277  cytochrome c oxidase, subunit I  68.03 
 
 		 537 aa  752    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  69.04 
 
 		 534 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  68.88 
 
 		 544 aa  730    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  69.67 
 
 		 556 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  66.99 
 
 		 539 aa  721    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0037  cytochrome-c oxidase  78.79 
 
 		 516 aa  840    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  68.41 
 
 		 544 aa  726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  66.91 
 
 		 537 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  68.31 
 
 		 544 aa  724    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  91.4 
 
 		 535 aa  992    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  78.95 
 
 		 536 aa  862    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04020  cytochrome c oxidase, subunit I  66.79 
 
 		 534 aa  727    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  70 
 
 		 536 aa  735    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  68.47 
 
 		 535 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  93.79 
 
 		 531 aa  1009    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  69.59 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  80.47 
 
 		 529 aa  860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  69.7 
 
 		 543 aa  758    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4245  cytochrome-c oxidase  84.96 
 
 		 532 aa  913    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3010  Cytochrome-c oxidase  59.89 
 
 		 533 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  69.59 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  94.27 
 
 		 536 aa  1000    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  93.79 
 
 		 530 aa  1006    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  93.97 
 
 		 530 aa  1009    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  76.88 
 
 		 526 aa  820    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  92.09 
 
 		 531 aa  1002    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  86.69 
 
 		 537 aa  907    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  69.59 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  81.02 
 
 		 530 aa  861    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  69.59 
 
 		 535 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  93.97 
 
 		 530 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  93.79 
 
 		 530 aa  1009    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  70.06 
 
 		 547 aa  746    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  66.48 
 
 		 535 aa  727    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  55.22 
 
 		 540 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  52.62 
 
 		 532 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  54.92 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  55.07 
 
 		 542 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  53.72 
 
 		 542 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  51.1 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  55.04 
 
 		 537 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  55.51 
 
 		 541 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  53.48 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  55.11 
 
 		 535 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  54.83 
 
 		 540 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  54.86 
 
 		 542 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  53.99 
 
 		 542 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>