202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3457 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  49.03 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  49.03 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  46.53 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  46.04 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  47.57 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  46.34 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  41.09 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  43.07 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  37.95 
 
 		 206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  36.54 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  37.24 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  39.8 
 
 		 207 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.89 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.89 
 
 		 207 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  40.4 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.54 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.54 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.06 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  36.32 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.27 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.54 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  35.71 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.73 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  34.98 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  36.73 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  37.76 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  32.99 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  35.9 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  48.35 
 
 		 131 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  30.93 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30.05 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  42.39 
 
 		 405 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  40 
 
 		 368 aa  85.1  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  40.82 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  30.05 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  33.49 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  39.8 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  38.24 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  31.66 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  38.32 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  29.17 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  27.96 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  40.23 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  40.51 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  25.37 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  31.77 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  34.04 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  39.13 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  39.02 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.68 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 367 aa  68.2  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  37.97 
 
 		 458 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.58 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.62 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  33.73 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  36.05 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.8 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  37.62 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  40 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.64 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  32.18 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  30.43 
 
 		 362 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  32.56 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.4 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  30.34 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  45.61 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  33.33 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  46.03 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  36.84 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  33.33 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  31.4 
 
 		 396 aa  58.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  30.33 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  39.76 
 
 		 582 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  35.9 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  34.57 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  41.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  41.54 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  41.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  43.86 
 
 		 371 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  31.87 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  31.48 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  41.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  41.54 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  41.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  31.4 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  41.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  41.54 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  41.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  37.18 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  37.18 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  35.63 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  45.61 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  30.59 
 
 		 369 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  30.23 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  32.93 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  31.52 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  27.06 
 
 		 369 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  28.87 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.22 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>