More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3444 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  78.64 
 
 
443 aa  736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  79.23 
 
 
443 aa  746    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  79.23 
 
 
443 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  80.14 
 
 
461 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  79.91 
 
 
443 aa  750    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  79.01 
 
 
443 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  79.46 
 
 
443 aa  749    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  80.36 
 
 
443 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  78.82 
 
 
441 aa  729    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  79.68 
 
 
443 aa  748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  80.18 
 
 
443 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  79.91 
 
 
443 aa  749    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  81.13 
 
 
443 aa  732    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  77.43 
 
 
442 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  79.46 
 
 
443 aa  743    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  917    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  61.33 
 
 
447 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  58.64 
 
 
440 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  41.89 
 
 
457 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  41.4 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  41.4 
 
 
441 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  39.9 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  36.52 
 
 
443 aa  275  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  36.99 
 
 
876 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  36.07 
 
 
453 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.16 
 
 
493 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  35.63 
 
 
431 aa  249  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  33.26 
 
 
452 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  35.97 
 
 
470 aa  246  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  34.76 
 
 
494 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  37.32 
 
 
466 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  34.7 
 
 
477 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  35.38 
 
 
501 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  34.46 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  34.86 
 
 
453 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  36.84 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  34.22 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  34.45 
 
 
422 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  33.72 
 
 
463 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  31.73 
 
 
526 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  31.68 
 
 
528 aa  226  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  33.25 
 
 
514 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  32.55 
 
 
504 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  31.52 
 
 
520 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  35.23 
 
 
459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  32.45 
 
 
513 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  31.46 
 
 
539 aa  223  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  36.1 
 
 
459 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  33.98 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  33.57 
 
 
465 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  33.57 
 
 
465 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  31.37 
 
 
532 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  32.81 
 
 
453 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
440 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  32.94 
 
 
465 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.33 
 
 
506 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  34.82 
 
 
954 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  32.32 
 
 
518 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  34.44 
 
 
484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  34.05 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
482 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  32.2 
 
 
453 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  33.74 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.12 
 
 
469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  31.69 
 
 
550 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  34.97 
 
 
414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  32.53 
 
 
896 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
413 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  32.58 
 
 
461 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  31.28 
 
 
947 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  32.99 
 
 
413 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  30.57 
 
 
501 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  32.4 
 
 
921 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  32.21 
 
 
414 aa  209  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.21 
 
 
455 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 
448 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  33.5 
 
 
464 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  32.37 
 
 
448 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  30.83 
 
 
416 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  30.83 
 
 
416 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  31.38 
 
 
450 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  31.03 
 
 
451 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  30.19 
 
 
508 aa  207  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  29.34 
 
 
440 aa  207  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  31.63 
 
 
451 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  30.91 
 
 
416 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
943 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  34.31 
 
 
434 aa  206  9e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  30.51 
 
 
450 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  33.42 
 
 
411 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  31.31 
 
 
453 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  32.59 
 
 
472 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.97 
 
 
454 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  34.78 
 
 
473 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.67 
 
 
456 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  30.05 
 
 
947 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  31.4 
 
 
417 aa  204  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>