More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3414 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  100 
 
 
677 aa  1405    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  45.49 
 
 
501 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  43.81 
 
 
504 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  42.55 
 
 
523 aa  360  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  47.55 
 
 
417 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  48.8 
 
 
408 aa  301  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  45.21 
 
 
417 aa  301  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  44.36 
 
 
408 aa  299  9e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  42.51 
 
 
417 aa  299  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  48.5 
 
 
408 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  48.2 
 
 
384 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  48.2 
 
 
408 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  48.2 
 
 
384 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  48.2 
 
 
384 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  48.2 
 
 
384 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  41.93 
 
 
417 aa  290  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  45.09 
 
 
417 aa  290  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  45.09 
 
 
417 aa  290  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  46.91 
 
 
778 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  46.91 
 
 
778 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  45.99 
 
 
775 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  46.55 
 
 
778 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  45.82 
 
 
778 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  46.01 
 
 
777 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  48.54 
 
 
774 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  42.58 
 
 
483 aa  238  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  47.41 
 
 
823 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  37.91 
 
 
401 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  36.46 
 
 
401 aa  187  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  35.49 
 
 
397 aa  174  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  37.78 
 
 
780 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  36.36 
 
 
407 aa  171  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  34.81 
 
 
397 aa  170  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  34.32 
 
 
390 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  30.85 
 
 
402 aa  151  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1158  hypothetical protein  33.57 
 
 
398 aa  145  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1163  hypothetical protein  32.61 
 
 
398 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  51.56 
 
 
553 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.23 
 
 
803 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.24 
 
 
818 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  45 
 
 
807 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.28 
 
 
819 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.86 
 
 
807 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.36 
 
 
819 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.36 
 
 
819 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.36 
 
 
819 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.79 
 
 
823 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  48.65 
 
 
658 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.19 
 
 
802 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  46 
 
 
803 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.04 
 
 
805 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.04 
 
 
805 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.48 
 
 
628 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.97 
 
 
809 aa  104  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.86 
 
 
807 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  50.51 
 
 
789 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  48.11 
 
 
789 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.53 
 
 
494 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.46 
 
 
629 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.46 
 
 
629 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  41.33 
 
 
794 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.65 
 
 
629 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.65 
 
 
629 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  31.32 
 
 
338 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.79 
 
 
1158 aa  97.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.45 
 
 
630 aa  95.1  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  36.09 
 
 
1151 aa  93.6  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  38.41 
 
 
818 aa  92  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.06 
 
 
836 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.41 
 
 
835 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  52.75 
 
 
948 aa  91.3  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  50.55 
 
 
944 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  50.55 
 
 
944 aa  91.3  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  38.52 
 
 
701 aa  91.3  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  50.55 
 
 
944 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  50.55 
 
 
944 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  38.61 
 
 
713 aa  90.9  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 
940 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.37 
 
 
835 aa  90.1  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.2 
 
 
835 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  39.36 
 
 
533 aa  87.8  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  47.83 
 
 
2066 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.39 
 
 
579 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  39.42 
 
 
489 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  48.89 
 
 
1150 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.71 
 
 
944 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.05 
 
 
942 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  41.41 
 
 
542 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.18 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  36.61 
 
 
609 aa  80.5  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  31.52 
 
 
840 aa  80.5  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  37.82 
 
 
948 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  37.74 
 
 
948 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  37.5 
 
 
534 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  37.11 
 
 
948 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  40.62 
 
 
816 aa  79  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  38.74 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  38.74 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  29.05 
 
 
1528 aa  78.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  40.46 
 
 
1565 aa  78.2  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>