287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3403 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3403  proline iminopeptidase, putative  100 
 
 
295 aa  600  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3908  prolyl aminopeptidase  50.52 
 
 
310 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0303  alpha/beta hydrolase fold  48.08 
 
 
317 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.136921  hitchhiker  0.000000724051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0316  alpha/beta hydrolase fold  49.49 
 
 
317 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  49.49 
 
 
321 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0315  alpha/beta hydrolase fold  49.49 
 
 
317 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0142975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3544  alpha/beta hydrolase fold  47.74 
 
 
316 aa  255  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.369893  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0320  alpha/beta hydrolase fold  49.15 
 
 
317 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4617  prolyl aminopeptidase  47.57 
 
 
315 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.920468  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4400  proline iminopeptidase, putative  48.08 
 
 
318 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3707  prolyl aminopeptidase  48.75 
 
 
301 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0312  prolyl aminopeptidase  48.04 
 
 
301 aa  236  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.361295  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0317  prolyl aminopeptidase  46.98 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.463031  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2776  proline iminopeptidase  33.92 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00879626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  38.15 
 
 
323 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0863  proline iminopeptidase  31.45 
 
 
318 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36.95 
 
 
323 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2590  proline iminopeptidase  39.84 
 
 
328 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.704595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3551  proline iminopeptidase  36.33 
 
 
328 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  36.55 
 
 
323 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0299  prolyl aminopeptidase  37.65 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  36.9 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  36.55 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  36.14 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  35.2 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  36.55 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03901  proline iminopeptidase  32.75 
 
 
316 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0624161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2907  prolyl aminopeptidase  37.65 
 
 
326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  36.14 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  36.55 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  33.85 
 
 
335 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67110  prolyl aminopeptidase  36.36 
 
 
323 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5819  prolyl aminopeptidase  36.36 
 
 
323 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2133  proline iminopeptidase  36.51 
 
 
315 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3964  proline iminopeptidase  31.19 
 
 
318 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0360  proline iminopeptidase  32.07 
 
 
316 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0712  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  36 
 
 
314 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0121198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  35.89 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  32.53 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  33.09 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03911  proline iminopeptidase  32.85 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.480314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2011  proline iminopeptidase  35.55 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0118869  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0208  proline iminopeptidase  36.8 
 
 
316 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3951  proline iminopeptidase  31.74 
 
 
322 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  43.1 
 
 
320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2767  proline iminopeptidase  37.4 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0887  prolyl aminopeptidase  35.8 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1122  proline iminopeptidase  33.77 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.29642  normal  0.0858208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6305  proline iminopeptidase  33.68 
 
 
329 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2836  proline iminopeptidase  37.65 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3091  proline iminopeptidase  35.38 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0253  proline iminopeptidase  28.15 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.381332  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0089  proline iminopeptidase  37.7 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1402  proline iminopeptidase  33.18 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2994  prolyl aminopeptidase  32.87 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0267164  normal  0.7335 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0084  prolyl aminopeptidase  34.85 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.826118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  34.81 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1598  proline iminopeptidase  35.34 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  35.94 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1174  prolyl aminopeptidase  37.25 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.651315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3473  proline iminopeptidase  32.56 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.598272  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  42.53 
 
 
310 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  35.74 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  35.74 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
310 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
310 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  35.66 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0850  prolyl aminopeptidase  34.25 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  42.53 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0763  proline iminopeptidase  34.25 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1088  proline iminopeptidase  35.06 
 
 
326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04582  proline iminopeptidase  34.13 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0523  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.870437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  29.47 
 
 
325 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf626  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
315 aa  127  3e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0168  proline iminopeptidase  33.73 
 
 
323 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8864  Prolyl aminopeptidase  34 
 
 
319 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1122  proline iminopeptidase  32.18 
 
 
316 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.332223  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1492  proline iminopeptidase  31.48 
 
 
330 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0426318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0691  proline iminopeptidase  33.87 
 
 
313 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.527577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0431  proline iminopeptidase  35.71 
 
 
318 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  44 
 
 
429 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12631  hydrolases or acyltransferases  32.93 
 
 
316 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  44 
 
 
429 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3492  prolyl aminopeptidase  32.8 
 
 
317 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  44 
 
 
429 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  44 
 
 
312 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  44 
 
 
312 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  44 
 
 
312 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  43.33 
 
 
436 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2838  proline iminopeptidase  35.06 
 
 
321 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3085  proline iminopeptidase  32.67 
 
 
345 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  30 
 
 
319 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3920  proline iminopeptidase  32.35 
 
 
317 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.805731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  30.42 
 
 
317 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3807  proline iminopeptidase  32.35 
 
 
317 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.180049 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5441  proline iminopeptidase  43.41 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139374  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0407  proline iminopeptidase  35.5 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3255  proline iminopeptidase  36.95 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.189812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>