More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3389 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  79.51 
 
 		 436 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  77.27 
 
 		 429 aa  688    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  77.27 
 
 		 429 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  77.27 
 
 		 429 aa  687    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  77.27 
 
 		 429 aa  687    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  76.76 
 
 		 435 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  77.48 
 
 		 435 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  73.84 
 
 		 422 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  77.97 
 
 		 429 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  77 
 
 		 435 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  100 
 
 		 424 aa  881    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  72.68 
 
 		 424 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  70.52 
 
 		 420 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  69.83 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  67.38 
 
 		 420 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  61.88 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  62.47 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  60.95 
 
 		 409 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  59.75 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  59.75 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  57.28 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  57.53 
 
 		 405 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  56.97 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  54.73 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  55.15 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  54.73 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  56.19 
 
 		 416 aa  462  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  53.85 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  54.34 
 
 		 419 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  53.87 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  53.35 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  53.6 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  53.33 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  42.44 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  41.98 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  41.73 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  40.25 
 
 		 415 aa  322  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  38.99 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  39.54 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  31.5 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  30.12 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.23 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  32.19 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  33.96 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  28.83 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  28.83 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  32.18 
 
 		 444 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  31.65 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  33.64 
 
 		 449 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.86 
 
 		 449 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  33.73 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  34.25 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  30.41 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.1 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  32.61 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  31.56 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  31.56 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  31.56 
 
 		 480 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  31.28 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  30.13 
 
 		 491 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  30 
 
 		 506 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 647 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  28.13 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  28.24 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  27.63 
 
 		 587 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  27.63 
 
 		 584 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  28.42 
 
 		 618 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 566 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 566 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2641  monooxygenase, FAD-binding  27.46 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0260  monooxygenase FAD-binding  24.7 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.958147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02880  halogenase  28.44 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.39 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  25.79 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  25.79 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  23.45 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  25.79 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  25.14 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  25.14 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  25.5 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  24.57 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  25.5 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  25.5 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  25.5 
 
 		 573 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5928  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.92 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  23.38 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.87 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0828  FAD dependent oxidoreductase  23.31 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.17 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>