More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3313 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  100 
 
 
514 aa  1041    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  65.11 
 
 
526 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  55.39 
 
 
789 aa  465  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.79 
 
 
807 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.25 
 
 
803 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  46.02 
 
 
807 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.06 
 
 
805 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.72 
 
 
809 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3162  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.76 
 
 
543 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177636  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  46.3 
 
 
803 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  43.45 
 
 
794 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.7 
 
 
807 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  44.36 
 
 
677 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.35 
 
 
606 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000745292  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.7 
 
 
521 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.33 
 
 
802 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.86 
 
 
823 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.32 
 
 
521 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.51 
 
 
521 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.69 
 
 
819 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.69 
 
 
819 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.69 
 
 
819 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.69 
 
 
819 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.99 
 
 
818 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.85 
 
 
605 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0753  alkaline serine protease  44.99 
 
 
609 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.06 
 
 
805 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.91 
 
 
608 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.42 
 
 
613 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0917  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.99 
 
 
608 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0197096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3431  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.97 
 
 
607 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.23 
 
 
607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.31 
 
 
608 aa  362  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000004601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2300  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 
606 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  44.87 
 
 
789 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.33 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  47.42 
 
 
533 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.79 
 
 
699 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46872  predicted protein  37.05 
 
 
670 aa  246  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.25 
 
 
370 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48262  predicted protein  33.44 
 
 
559 aa  157  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  35.79 
 
 
399 aa  156  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.57 
 
 
396 aa  130  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.43 
 
 
639 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.1 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.03 
 
 
368 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.8 
 
 
397 aa  127  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.66 
 
 
431 aa  126  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.77 
 
 
423 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  33.1 
 
 
397 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.33 
 
 
891 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  32.06 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  32.06 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  32.06 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  32.06 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  32.06 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  30.16 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  32.75 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  32.4 
 
 
397 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  32.4 
 
 
397 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.61 
 
 
669 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.66 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.34 
 
 
298 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.09 
 
 
540 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  31.56 
 
 
576 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  32.64 
 
 
316 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  32.64 
 
 
316 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  34.94 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 
640 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.15 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
638 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  32.22 
 
 
316 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.93 
 
 
449 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  32.22 
 
 
316 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  32.22 
 
 
316 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  32.22 
 
 
316 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.39 
 
 
577 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.96 
 
 
316 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.22 
 
 
444 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.92 
 
 
474 aa  110  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  32.22 
 
 
316 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.08 
 
 
1054 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.53 
 
 
595 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.7 
 
 
453 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 
406 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.16 
 
 
483 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  31.38 
 
 
315 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3301  putative serine protease  30.65 
 
 
407 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44867 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  30.13 
 
 
315 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.76 
 
 
452 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.71 
 
 
423 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  32.58 
 
 
307 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
860 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38 
 
 
653 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.63 
 
 
320 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.63 
 
 
320 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.66 
 
 
860 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.09 
 
 
295 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.48 
 
 
495 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>