More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3260 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  78.26 
 
 		 460 aa  750    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4319  HlyD family secretion protein  80.22 
 
 		 484 aa  757    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 460 aa  931    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4100  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80 
 
 		 460 aa  753    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0311  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80 
 
 		 460 aa  771    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3907  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  80 
 
 		 460 aa  753    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3984  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80 
 
 		 460 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4006  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80 
 
 		 460 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0380  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80.22 
 
 		 460 aa  756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  79.78 
 
 		 460 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3593  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80.22 
 
 		 460 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  78.04 
 
 		 460 aa  726    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0382  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80.65 
 
 		 460 aa  761    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3644  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  80.65 
 
 		 460 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0434  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  78.04 
 
 		 460 aa  735    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4141  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  79.13 
 
 		 460 aa  758    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.504346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  49.23 
 
 		 481 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  49.23 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07089  hypothetical protein  48.14 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  45.95 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  42.16 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.49 
 
 		 453 aa  360  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  41.32 
 
 		 440 aa  360  4e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.13 
 
 		 453 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  43.55 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.58 
 
 		 451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1460  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1292  HlyD family secretion protein  41.89 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.969928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.79 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.11 
 
 		 433 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  37.58 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.69 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.37 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.46 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  40.04 
 
 		 458 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0004  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.49 
 
 		 442 aa  329  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.197437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0136  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  41.29 
 
 		 455 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  40.88 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.24 
 
 		 468 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.78 
 
 		 446 aa  319  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  37.78 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  40.09 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1474  secretion system protein D  40.58 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.15 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.91 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1976  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.6 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.13 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.96 
 
 		 458 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000605389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0184  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  41.07 
 
 		 458 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0185  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  39.96 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.116801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1159  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.46 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  39.62 
 
 		 471 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  38.39 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1876  HlyD family secretion protein  40.91 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  39.25 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1663  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  40.1 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.131459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2243  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.03 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4206  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  38.79 
 
 		 437 aa  289  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  36.72 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0565  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  36.01 
 
 		 455 aa  279  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.59 
 
 		 389 aa  279  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  37.82 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.16 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  36.6 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0636  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.03 
 
 		 674 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40230  putative secretion protein  35.81 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.975175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0585  membrane spanning export protein  35.92 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.836061  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3409  putative secretion protein  36.05 
 
 		 395 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3122  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.64 
 
 		 399 aa  253  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.2 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  34.43 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  34.43 
 
 		 471 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.14 
 
 		 468 aa  246  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.31 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.53 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2166  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.68 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4383  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  36.56 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.915143  normal  0.374406 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3021  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.5 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0405011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4600  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.41 
 
 		 410 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2908  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.27 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2907  type I secretion membrane fusion protein HlyD family  34.73 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.891206  normal  0.048093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2889  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.73 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0810996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2838  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  34.73 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0842  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.84 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2412  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  34.1 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.449428  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1759  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  33.63 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0119826 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0803  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.59 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0827  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.59 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.72853  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_003296  RS05073  putative hemolysin-type secretion transmembrane protein  35.32 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  30.33 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.02 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  31.31 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2502  secretion protein  32.68 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.867679 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.34 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0528  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.76 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.178429 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0761  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  31.81 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30.11 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.65 
 
 		 403 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4324  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.23 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.415601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>