71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3203 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  44.33 
 
 
207 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  46.38 
 
 
206 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  43.9 
 
 
207 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  46.12 
 
 
206 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  42.44 
 
 
206 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  45.15 
 
 
206 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  44.66 
 
 
206 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  44.66 
 
 
206 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  46.34 
 
 
206 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  45.89 
 
 
206 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  41.75 
 
 
207 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  42.93 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  43.2 
 
 
206 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  43.2 
 
 
206 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  38.12 
 
 
207 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  33.53 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  32.54 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  32.35 
 
 
211 aa  95.5  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  32.12 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  31.61 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  28.95 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  32.94 
 
 
201 aa  89  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  33.5 
 
 
213 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  31.47 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  30.59 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  30.59 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  31.18 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  34.1 
 
 
213 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  31.44 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  31.18 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  31.18 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  30.59 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  30.59 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  35.06 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  30.59 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  26.95 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  32.14 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  28.82 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  27.32 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  28.04 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  28.49 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  25.16 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  26.99 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  27.49 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  27.88 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  28.19 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  26.42 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.79 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  25.48 
 
 
207 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  26.32 
 
 
192 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  24.56 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  24.56 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  24.29 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  24.29 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  24.62 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  24.5 
 
 
208 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  24.5 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  26.92 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  25.16 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  22.14 
 
 
208 aa  42  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  21.64 
 
 
213 aa  41.6  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>