More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3185 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 360 aa  728    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.39 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.39 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.11 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.11 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.55 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.27 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.39 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  57.87 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0970  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.43 
 
 		 362 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  48.89 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 		 362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  45.81 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  44.41 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.73 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  33.61 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3390  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.927334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3483  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3320  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.781767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3310  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.740696  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3384  putative methyl-accepting chemotaxis protein  32.23 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644477  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  30.85 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  30.85 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 		 635 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  34.89 
 
 		 365 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 421 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 720 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 632 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 720 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 483 aa  126  7e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  37.2 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 658 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  32.03 
 
 		 645 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  34.04 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1836  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126283  normal  0.522282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.07 
 
 		 674 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 815 aa  103  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  41.14 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  39.78 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.52 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  29.5 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 622 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  27.1 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  28.66 
 
 		 459 aa  99.8  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  40.45 
 
 		 488 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3730  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 		 529 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000264918 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  47.66 
 
 		 473 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03655  putative chemotaxis transducer  43.97 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  38.18 
 
 		 545 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  28.35 
 
 		 459 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 		 497 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  57.65 
 
 		 563 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 		 500 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 620 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.17 
 
 		 502 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00626539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2599  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 501 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000558383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 620 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 		 499 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  41.91 
 
 		 587 aa  96.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  45.95 
 
 		 476 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.72 
 
 		 620 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.31 
 
 		 479 aa  96.3  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 		 531 aa  96.3  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  49.51 
 
 		 524 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  42.54 
 
 		 712 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 452 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 		 716 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  42.54 
 
 		 712 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  36.02 
 
 		 619 aa  95.9  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  38.62 
 
 		 545 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 		 687 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3357  putative chemotaxis transducer  43.56 
 
 		 431 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0800566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 520 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  58.82 
 
 		 629 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  31.17 
 
 		 459 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1807  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.1 
 
 		 560 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  39.47 
 
 		 547 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1862  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 505 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.149959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.92 
 
 		 523 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 495 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2420  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.13 
 
 		 506 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0671416  hitchhiker  0.00255163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 		 658 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 620 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  37.95 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>