More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3030 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.73 
 
 		 494 aa  635    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.87 
 
 		 499 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.67 
 
 		 499 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.87 
 
 		 499 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  66.27 
 
 		 499 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  100 
 
 		 496 aa  996    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  64.27 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.12 
 
 		 494 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  65.52 
 
 		 494 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  64.92 
 
 		 494 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  61.55 
 
 		 492 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  61.4 
 
 		 492 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57.03 
 
 		 488 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  57.38 
 
 		 492 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.6 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  44 
 
 		 508 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  44.42 
 
 		 514 aa  362  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  44.22 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  44.22 
 
 		 514 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  43.81 
 
 		 512 aa  362  1e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  44.22 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  44.22 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  43.51 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  43.51 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  43.51 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  43.31 
 
 		 515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  43.31 
 
 		 515 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  43.31 
 
 		 510 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.31 
 
 		 515 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  43.11 
 
 		 510 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  42.91 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  43.26 
 
 		 514 aa  349  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  42.48 
 
 		 510 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  45.81 
 
 		 462 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  43.64 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  42.11 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  42.11 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  41.9 
 
 		 504 aa  339  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  44.47 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  42.36 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  40.9 
 
 		 513 aa  332  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  44.47 
 
 		 486 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  43.17 
 
 		 513 aa  329  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.6 
 
 		 499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  45.19 
 
 		 490 aa  319  7e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  46.12 
 
 		 436 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  40.32 
 
 		 494 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38 
 
 		 504 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  36.96 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  40.04 
 
 		 524 aa  293  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  41.6 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  40.32 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.09 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  41.99 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0568  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.87 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000379756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  39.6 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1272  hypothetical protein  39.84 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  41.3 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  40.88 
 
 		 500 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  38.52 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2755  hypothetical protein  37.93 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2628  hypothetical protein  37.93 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2019  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.55 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000259128  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.13 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00413  YjeF family protein  40.32 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  41.94 
 
 		 496 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.15 
 
 		 496 aa  247  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  31.62 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.41 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2774  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.06 
 
 		 520 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.966522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  31.36 
 
 		 499 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.07 
 
 		 510 aa  229  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0491  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.2 
 
 		 504 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0936655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.39 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.59 
 
 		 509 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.62 
 
 		 516 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  34.97 
 
 		 517 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.84 
 
 		 529 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2379  hypothetical protein  37.36 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.95 
 
 		 498 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 		 500 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.58 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  37.4 
 
 		 512 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  38.38 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.93 
 
 		 492 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.91 
 
 		 531 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.29 
 
 		 506 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.53 
 
 		 286 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.59 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  36.26 
 
 		 522 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.36 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.95 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.21 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  35.4 
 
 		 526 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1145  YjeF-related protein-like protein  37.45 
 
 		 495 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0478432  normal  0.107568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  47.45 
 
 		 307 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.66 
 
 		 501 aa  202  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.74 
 
 		 286 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.91 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  46.74 
 
 		 307 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>