27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3005 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  235  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  55.65 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  57.69 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  57.69 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  57.69 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  55.77 
 
 		 115 aa  123  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  55.77 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  55.77 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  55.77 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  53.85 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  54.55 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  49.11 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  43.81 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  47.42 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  49.45 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  27.38 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  28.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  36.23 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.32 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  29.23 
 
 		 88 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  34.18 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  27.69 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  27.69 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  27.69 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  27.69 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.69 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  27.69 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>