114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2882 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 178 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  64.74 
 
 		 173 aa  254  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  62.35 
 
 		 173 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  62.94 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  61.76 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  60.59 
 
 		 173 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  61.76 
 
 		 173 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  61.18 
 
 		 173 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  61.18 
 
 		 173 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  60.59 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0813  protoporphyrinogen oxidase  63.53 
 
 		 173 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  61.27 
 
 		 173 aa  228  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  57.23 
 
 		 175 aa  222  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0673  protoporphyrinogen oxidase  54.8 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3720  hypothetical protein  66.17 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0025  protoporphyrinogen oxidase  49.71 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2953  protoporphyrinogen oxidase  49.14 
 
 		 175 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.410486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  48.57 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0022  protoporphyrinogen oxidase  49.71 
 
 		 175 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0023  protoporphyrinogen oxidase  48.55 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000262535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0024  protoporphyrinogen oxidase  49.12 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0780321  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0025  protoporphyrinogen oxidase  49.12 
 
 		 174 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0214113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0036  protoporphyrinogen oxidase  50.29 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.144256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0020  protoporphyrinogen oxidase  48.54 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000993803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0027  protoporphyrinogen oxidase  47.65 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00412155  normal  0.0535555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  46.86 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0024  Protoporphyrinogen oxidase  48.54 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.776203  hitchhiker  0.00000179508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0028  protoporphyrinogen oxidase  48.55 
 
 		 174 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000780551  hitchhiker  0.000000145429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0022  protoporphyrinogen oxidase  48.55 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000530188  hitchhiker  0.000763246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0020  protoporphyrinogen oxidase  48.55 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000664462  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0017  protoporphyrinogen oxidase  49.71 
 
 		 174 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.324297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0017  protoporphyrinogen oxidase  47.16 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.229911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0019  protoporphyrinogen oxidase  49.11 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0141  Protoporphyrinogen oxidase  46.47 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0025  flavodoxin  46.24 
 
 		 174 aa  167  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4230  protoporphyrinogen oxidase  45.93 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0023265  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  44 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09631  putative protoporphyrinogen oxidase  41.95 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2537  protoporphyrinogen oxidase  43.53 
 
 		 174 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  44.97 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4040  protoporphyrinogen oxidase  44.77 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00450028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  43.1 
 
 		 179 aa  147  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2977  protoporphyrinogen oxidase  44.19 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4266  protoporphyrinogen oxidase  43.35 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000166727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4313  protoporphyrinogen oxidase  43.35 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  0.107941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4194  protoporphyrinogen oxidase  43.35 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000219448  normal  0.630031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4217  protoporphyrinogen oxidase  43.35 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000339833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4373  protoporphyrinogen oxidase  43.35 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000903845  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03741  protoporphyrin oxidase, flavoprotein  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00160389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4131  Protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000348526  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4073  protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000311087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4369  protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000843735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4160  protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000131743  decreased coverage  0.00000239257 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4231  protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000133684  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5289  protoporphyrinogen oxidase  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000241436  normal  0.0811334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03690  hypothetical protein  43.93 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000962205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3945  protoporphyrinogen oxidase  43.26 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000851494  decreased coverage  0.00158179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4320  protoporphyrinogen oxidase  43.35 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000364139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  42.44 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  41.28 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0038  protoporphyrinogen oxidase  36.21 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0266  protoporphyrinogen oxidase  40.46 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0106275  normal  0.013044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  42.2 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0287  protoporphyrinogen oxidase  37.57 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1916  protoporphyrinogen oxidase  37.57 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000017226  normal  0.191063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3929  protoporphyrinogen oxidase  37.57 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0024  protoporphyrinogen oxidase  35.03 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.000782857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0022  protoporphyrinogen oxidase  35.03 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00158221  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0030  protoporphyrinogen oxidase  35.03 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000025966  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0027  protoporphyrinogen oxidase, putative  35.03 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0026  protoporphyrinogen oxidase  34.46 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00716362  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0027  protoporphyrinogen oxidase  34.46 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0370554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0019  protoporphyrinogen oxidase  35.03 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0022  protoporphyrinogen oxidase  34.46 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0671098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0026  Protoporphyrinogen oxidase  34.46 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000181014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0026  protoporphyrinogen oxidase  32.58 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0029  protoporphyrinogen oxidase  34.83 
 
 		 179 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0027  protoporphyrinogen oxidase  33.71 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3403  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.75 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200863  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0025  protoporphyrinogen oxidase  30.68 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0019  protoporphyrinogen oxidase  32.57 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827877  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.12 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  35.06 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  32.2 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  32.95 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  23.98 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1824  flavodoxin  25 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  25.48 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.23 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  36.67 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  23.74 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  25.29 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2562  Flavodoxin-like protein  24.19 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  31.11 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  32.11 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2314  flavodoxin-like  22.99 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0403811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0852  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0227417  normal  0.141132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0340  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.46 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.687368 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  21.05 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>