More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2813 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
262 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
262 aa  344  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  67.95 
 
 
258 aa  341  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  65.27 
 
 
262 aa  342  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
262 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  64.89 
 
 
262 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  64.09 
 
 
259 aa  339  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  64.89 
 
 
262 aa  337  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  64.09 
 
 
259 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  64.86 
 
 
259 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
262 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
262 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  65.65 
 
 
262 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  58.69 
 
 
259 aa  308  8e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450671  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  62.79 
 
 
257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  47.16 
 
 
284 aa  248  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  47.2 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
270 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000327368  normal  0.0501049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
270 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000540131  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
270 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
270 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
270 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  48.72 
 
 
277 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000771944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  48.72 
 
 
277 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000544251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  48.72 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128794  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  48.34 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000304706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  47.99 
 
 
271 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000477601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  47.62 
 
 
271 aa  231  9e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  47.62 
 
 
271 aa  231  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000271898  hitchhiker  0.00000323028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  47.62 
 
 
271 aa  231  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000026636  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  47.62 
 
 
271 aa  231  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000128159  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  47.62 
 
 
271 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000204638  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  44.67 
 
 
291 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  47.25 
 
 
271 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000613097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  47.58 
 
 
271 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  47.58 
 
 
271 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000167853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  47.23 
 
 
273 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000356276  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  44.07 
 
 
296 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.38 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  48.73 
 
 
275 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  44.57 
 
 
283 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  44.92 
 
 
284 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000787957  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  44.8 
 
 
284 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  43.77 
 
 
286 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  41.11 
 
 
271 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  41.03 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000570933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  43.02 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  42.23 
 
 
257 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  41.29 
 
 
271 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  41 
 
 
305 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.68 
 
 
260 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  37.2 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  38.2 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00001887  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  43.69 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  41.85 
 
 
264 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.85 
 
 
268 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  30.22 
 
 
296 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  30.71 
 
 
296 aa  141  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  53.66 
 
 
318 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.3 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000151297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.76 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  31.76 
 
 
241 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  31.35 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  27.38 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  28.08 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.63 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  28.24 
 
 
255 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.22 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.25 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  28.35 
 
 
257 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  27.31 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  33.67 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.28 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.03 
 
 
255 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  33.67 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  28.03 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.65 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  28.23 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3389  heat shock protein DnaJ-like  27.46 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.51 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  26.58 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  26.19 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.19 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.23 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1445  DnaJ domain-containing protein  28.44 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0302292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.03 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  26.48 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  26.54 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  24.79 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  26.39 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1401  DnaJ domain-containing protein  27.96 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.382181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0737  heat shock protein DnaJ domain protein  27.7 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120141  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  26.61 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  25.6 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.93 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  24.65 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  25.6 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  25.6 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>