More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2771 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0740  L-serine dehydratase 1  72.69 
 
 		 455 aa  676    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0864  L-serine dehydratase 1  68.5 
 
 		 455 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0859  L-serine ammonia-lyase  70.04 
 
 		 455 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2771  L-serine ammonia-lyase  100 
 
 		 464 aa  954    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0772  L-serine dehydratase 1  69.82 
 
 		 455 aa  662    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0918  L-serine dehydratase 1  66.37 
 
 		 453 aa  608  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000189103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2019  L-serine dehydratase 1  65.57 
 
 		 454 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1638  L-serine dehydratase  66.96 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2223  L-serine dehydratase 1  65.79 
 
 		 454 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2451  L-serine dehydratase 1  66.96 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1928  L-serine dehydratase 1  66.23 
 
 		 454 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2355  L-serine ammonia-lyase  66.96 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.615532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2810  L-serine dehydratase 1  66.08 
 
 		 461 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1985  L-serine dehydratase 1  65.49 
 
 		 453 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01784  L-serine deaminase I  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1829  L-serine dehydratase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.693137  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01772  hypothetical protein  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003155  L-serine dehydratase  66.15 
 
 		 453 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.225865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1904  L-serine dehydratase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2075  L-serine ammonia-lyase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1374  L-serine ammonia-lyase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.779144  normal  0.0170145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2543  L-serine ammonia-lyase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1490  L-serine ammonia-lyase  64.91 
 
 		 454 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2042  L-serine dehydratase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2027  L-serine ammonia-lyase  64.91 
 
 		 454 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.674197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01908  L-serine dehydratase 1  65.93 
 
 		 453 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1819  L-serine dehydratase 1  65.79 
 
 		 454 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.561411  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1966  L-serine ammonia-lyase  64.69 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1343  L-serine dehydratase 1  65.49 
 
 		 453 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2940  L-serine dehydratase 1  64.47 
 
 		 455 aa  596  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.544189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1305  L-serine ammonia-lyase  64.69 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0226237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1970  L-serine ammonia-lyase  64.69 
 
 		 454 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.328671  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02642  L-serine deaminase II  64.69 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0891  L-serine dehydratase 1  64.69 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0393995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2383  L-serine ammonia-lyase  64.91 
 
 		 454 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02604  hypothetical protein  64.69 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2941  L-serine ammonia-lyase  64.69 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.73805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0915  L-serine dehydratase 1  64.69 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3102  L-serine dehydratase 2  64.69 
 
 		 455 aa  591  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2937  L-serine ammonia-lyase 2  64.47 
 
 		 455 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.427341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1241  L-serine dehydratase 1  66 
 
 		 456 aa  591  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.341866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3075  L-serine ammonia-lyase 2  64.69 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.260671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4061  L-serine ammonia-lyase 2  64.69 
 
 		 455 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2667  L-serine dehydratase 1  65.49 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3586  L-serine dehydratase tdcG  64.6 
 
 		 454 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3245  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.6 
 
 		 454 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.346654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02979  L-serine dehydratase 3  64.6 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0591  L-serine dehydratase 1  64.38 
 
 		 454 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02930  hypothetical protein  64.6 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3250  L-serine dehydratase 1  62.72 
 
 		 455 aa  581  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.648772  normal  0.619841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3408  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.6 
 
 		 456 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0586  L-serine dehydratase 1  64.6 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3194  L-serine ammonia-lyase  64.04 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.500891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3131  L-serine ammonia-lyase  64.04 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3179  L-serine ammonia-lyase  64.04 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.434034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3114  L-serine ammonia-lyase  64.04 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.6475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3300  L-serine ammonia-lyase  64.6 
 
 		 454 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3294  L-serine ammonia-lyase  64.04 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4425  L-serine ammonia-lyase TdcG  64.38 
 
 		 456 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3598  L-serine ammonia-lyase  64.38 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.842995  normal  0.929959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3431  L-serine ammonia-lyase  64.08 
 
 		 454 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3502  L-serine ammonia-lyase  64.38 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3535  L-serine ammonia-lyase  64.16 
 
 		 454 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3428  L-serine ammonia-lyase  64.16 
 
 		 454 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0687  L-serine dehydratase 1  62.08 
 
 		 453 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1629  L-serine dehydratase 1  64.46 
 
 		 455 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.815804  hitchhiker  0.00237889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1325  L-serine ammonia-lyase  56.7 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.138393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2248  L-serine dehydratase 1  55.8 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2402  L-serine dehydratase 1  56.48 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000825911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01946  L-serine dehydratase 1  55.92 
 
 		 457 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0568801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1946  L-serine dehydratase 1  55.38 
 
 		 458 aa  510  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2171  L-serine dehydratase 1  55.36 
 
 		 458 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.633035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1625  L-serine dehydratase 1  55.48 
 
 		 457 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1725  L-serine ammonia-lyase  55.36 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0395889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1804  L-serine ammonia-lyase  55.36 
 
 		 458 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2295  L-serine ammonia-lyase  55.36 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2406  L-serine dehydratase 1  54.95 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2524  L-serine dehydratase 1  54.95 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.418304  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1942  L-serine dehydratase 1  54.95 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0383387  normal  0.499337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1538  L-serine dehydratase 1  54.82 
 
 		 458 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00324731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2417  L-serine dehydratase 1  54.95 
 
 		 458 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  55.36 
 
 		 458 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2838  L-serine ammonia-lyase  54.82 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.947815  hitchhiker  0.0000107679 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1625  L-serine dehydratase 1  54.17 
 
 		 458 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0594859  normal  0.120267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04899  L-serine dehydratase  54.97 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0608  L-serine dehydratase 1  56.43 
 
 		 476 aa  488  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1806  L-serine dehydratase 1  53.95 
 
 		 458 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000749  L-serine dehydratase  55.09 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  55.82 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1077  L-serine dehydratase  54.97 
 
 		 458 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  54.77 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04817  L-serine deaminase  54.3 
 
 		 456 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  54.39 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  57.49 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  54.65 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  54.39 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  54.3 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  51.81 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  53.83 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  53.06 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>