231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2661 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  100 
 
 		 484 aa  987    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  41.52 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  43.18 
 
 		 511 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  33.48 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  29.74 
 
 		 478 aa  143  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  28.98 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  25.82 
 
 		 680 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  27.9 
 
 		 666 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.43 
 
 		 686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  26.28 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.34 
 
 		 1005 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  24.16 
 
 		 672 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  25.05 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25.43 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  24.95 
 
 		 512 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  25.84 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  25.21 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  23.75 
 
 		 1014 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.08 
 
 		 1010 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  26.48 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  28.8 
 
 		 819 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  26.91 
 
 		 702 aa  97.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.73 
 
 		 1059 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.36 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.4 
 
 		 585 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  22.2 
 
 		 694 aa  90.5  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  22.27 
 
 		 692 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  24.2 
 
 		 540 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  25.97 
 
 		 433 aa  87  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  23.23 
 
 		 1052 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.77 
 
 		 1031 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  25.53 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  28.82 
 
 		 1042 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1042 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  25.33 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  28.57 
 
 		 1040 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  24.9 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  25 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  22.54 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  23.88 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  26.97 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  25.55 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.64 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  23 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  25.11 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  23.73 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  24.59 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  27.72 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  25.41 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  24.85 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  24.15 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  23.26 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  23.24 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.41 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.8 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.19 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  26.12 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.45 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  36.62 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  43.06 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  23.16 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  21.74 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  36.5 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.78 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  48.42 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  25.54 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  38.38 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  30.65 
 
 		 1111 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  39.76 
 
 		 1138 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  40.24 
 
 		 1069 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  23.13 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  30.11 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  36.64 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.6 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  40.24 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  37.35 
 
 		 1062 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.21 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.04 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  37.8 
 
 		 1066 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  37.8 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.01 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0846  amidohydrolase  23.57 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  23.68 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  23.08 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  23.68 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  24.31 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  20.95 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  40 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.53 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  21.93 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  21.46 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  33.59 
 
 		 1062 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  37.8 
 
 		 1060 aa  57.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  24.57 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  39.24 
 
 		 1071 aa  57.4  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  37.8 
 
 		 1081 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  37.8 
 
 		 1067 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>