193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2484 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  60.75 
 
 
617 aa  786  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  67.05 
 
 
616 aa  860  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  67.71 
 
 
613 aa  866  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  63.24 
 
 
624 aa  788  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  66.08 
 
 
627 aa  859  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  65.95 
 
 
613 aa  852  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  67.15 
 
 
616 aa  860  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  69.34 
 
 
615 aa  878  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  68.86 
 
 
628 aa  848  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  70 
 
 
615 aa  885  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  68.2 
 
 
618 aa  830  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  57.19 
 
 
602 aa  727  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  68.73 
 
 
614 aa  880  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  69.51 
 
 
615 aa  874  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  100 
 
 
625 aa  1295  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  69.18 
 
 
615 aa  876  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  67.05 
 
 
616 aa  860  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  67.21 
 
 
616 aa  862  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  51.01 
 
 
618 aa  625  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  50.08 
 
 
617 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  51.18 
 
 
625 aa  603  1e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  48.24 
 
 
605 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  44.5 
 
 
628 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  40.16 
 
 
629 aa  469  1e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  44.28 
 
 
607 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  44.28 
 
 
607 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  44.28 
 
 
607 aa  464  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  43.53 
 
 
608 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  43.04 
 
 
614 aa  447  1e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  43.22 
 
 
614 aa  448  1e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  44.16 
 
 
614 aa  445  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  43.04 
 
 
614 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  43.04 
 
 
617 aa  441  1e-122  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  42.65 
 
 
611 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  44.38 
 
 
622 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  35.98 
 
 
609 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  38.07 
 
 
607 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  35.86 
 
 
611 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  35.82 
 
 
609 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  36.1 
 
 
611 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  36.19 
 
 
609 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  37.63 
 
 
616 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.97 
 
 
609 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.9 
 
 
610 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  35.81 
 
 
609 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  35.48 
 
 
609 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.81 
 
 
609 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  35.61 
 
 
609 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  35.67 
 
 
609 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  35.21 
 
 
609 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  34.91 
 
 
616 aa  361  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  33.94 
 
 
585 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.09 
 
 
603 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.93 
 
 
603 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.09 
 
 
603 aa  342  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.27 
 
 
601 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.27 
 
 
601 aa  341  3e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  37.72 
 
 
583 aa  339  1e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.44 
 
 
603 aa  339  1e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.94 
 
 
601 aa  339  1e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.42 
 
 
601 aa  337  3e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.78 
 
 
1283 aa  337  3e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.28 
 
 
603 aa  330  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  33.66 
 
 
602 aa  329  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  31.34 
 
 
635 aa  328  2e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.2 
 
 
637 aa  327  3e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  35.98 
 
 
591 aa  327  4e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  35.27 
 
 
619 aa  323  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  33.39 
 
 
589 aa  322  1e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  35.41 
 
 
599 aa  321  2e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  35.06 
 
 
594 aa  321  2e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  34.79 
 
 
630 aa  320  5e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  35.6 
 
 
636 aa  320  5e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  32.96 
 
 
599 aa  319  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  34.47 
 
 
599 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  35.11 
 
 
628 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.65722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  34.42 
 
 
629 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  33.02 
 
 
635 aa  313  4e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  33.5 
 
 
635 aa  313  7e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  34.76 
 
 
608 aa  312  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  31.66 
 
 
633 aa  310  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.79 
 
 
605 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  34.73 
 
 
608 aa  310  5e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.7 
 
 
635 aa  310  7e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.45 
 
 
587 aa  309  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  34.29 
 
 
588 aa  308  1e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  37.11 
 
 
621 aa  303  7e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.2 
 
 
590 aa  300  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  35.36 
 
 
621 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  33.98 
 
 
605 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.27 
 
 
595 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  34.07 
 
 
592 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.43 
 
 
619 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  35.37 
 
 
613 aa  294  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  33.85 
 
 
604 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.59 
 
 
610 aa  293  8e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  32.33 
 
 
611 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  31.63 
 
 
609 aa  286  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  35.13 
 
 
586 aa  286  9e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  40.74 
 
 
584 aa  285  2e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>