More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2401 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  100 
 
 		 505 aa  1045    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  42.91 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  42.28 
 
 		 491 aa  363  4e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  38.4 
 
 		 511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  35.62 
 
 		 512 aa  315  8e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  38.15 
 
 		 517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  37.55 
 
 		 508 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  36.03 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 521 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  36.29 
 
 		 510 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.21 
 
 		 519 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  36.49 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  33.59 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  34.62 
 
 		 519 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.78 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 517 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  33.59 
 
 		 517 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  35.84 
 
 		 520 aa  259  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  32.16 
 
 		 506 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  34.95 
 
 		 517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  33.07 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  32.55 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  31.97 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  32.05 
 
 		 506 aa  251  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  33.48 
 
 		 447 aa  249  9e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  32.05 
 
 		 506 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  31.9 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  31.86 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.81 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  32.81 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  31.68 
 
 		 506 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  33.27 
 
 		 500 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  33.68 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  31.82 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.5 
 
 		 521 aa  220  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  30.83 
 
 		 505 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  30.33 
 
 		 507 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  30.2 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  32.58 
 
 		 599 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  30.37 
 
 		 506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  32.16 
 
 		 609 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.75 
 
 		 506 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  31.29 
 
 		 584 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  32.29 
 
 		 588 aa  183  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  30.28 
 
 		 586 aa  183  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.99 
 
 		 598 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  31.64 
 
 		 515 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.54 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.69 
 
 		 591 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  30.19 
 
 		 586 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 582 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  30.45 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  30.04 
 
 		 603 aa  170  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  30.61 
 
 		 515 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  30.61 
 
 		 515 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.79 
 
 		 582 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.33 
 
 		 925 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  28.97 
 
 		 582 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  29.75 
 
 		 606 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  28.72 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  30.43 
 
 		 957 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  28.26 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  28.26 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.04 
 
 		 591 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.52 
 
 		 608 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  27.47 
 
 		 605 aa  153  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.66 
 
 		 597 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.58 
 
 		 589 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.9 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  30.26 
 
 		 596 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  27.49 
 
 		 926 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  30.26 
 
 		 596 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.05 
 
 		 589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  30.98 
 
 		 589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  28.72 
 
 		 925 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  29.07 
 
 		 596 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  29.44 
 
 		 583 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  27.63 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.17 
 
 		 481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.92 
 
 		 596 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  28.42 
 
 		 596 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 596 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.4 
 
 		 593 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  27.33 
 
 		 596 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.53 
 
 		 598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  27.75 
 
 		 637 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  35.25 
 
 		 1005 aa  127  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.22 
 
 		 597 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.03 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  25.54 
 
 		 616 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>