44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2394 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2394  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  100 
 
 		 559 aa  1150    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2337  Cyanophycinase and related exopeptidase-like protein  39.6 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.704877  normal  0.140679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1987  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  39.66 
 
 		 541 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2050  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  39.87 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.338236  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2002  cyanophycinase-related exopeptidase-like protein  40.76 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.083735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1099  cyanophycinase  32.1 
 
 		 418 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.517521  normal  0.0298062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  32.85 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  31.13 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  31.05 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  25.5 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  29.92 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1095  cyanophycinase-like protein  26.64 
 
 		 587 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.092083  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  26.96 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  32.42 
 
 		 289 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  28.1 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  28.1 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  24.85 
 
 		 297 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  34.25 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  34.22 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  29.67 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  30.61 
 
 		 273 aa  59.7  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  30.23 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  29.74 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  29.56 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0514  cyanophycinase  32.34 
 
 		 291 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.226202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  27.31 
 
 		 274 aa  57  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  29.35 
 
 		 328 aa  56.6  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  27.72 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  30.64 
 
 		 281 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  29.08 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  27.74 
 
 		 269 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  33.78 
 
 		 284 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  30.05 
 
 		 275 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  28 
 
 		 269 aa  54.7  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  31.12 
 
 		 346 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  29.89 
 
 		 611 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  27.57 
 
 		 327 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  23.64 
 
 		 269 aa  50.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4153  cyanophycinase  29.07 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  28.49 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  30.19 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  28.85 
 
 		 458 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  30.41 
 
 		 348 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  27.31 
 
 		 278 aa  44.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>