More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2306 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  100 
 
 
272 aa  535  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  87.13 
 
 
273 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  85.29 
 
 
273 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  85.29 
 
 
273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  84.56 
 
 
272 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  83.46 
 
 
273 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  83.46 
 
 
272 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  82.72 
 
 
273 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  82.72 
 
 
272 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  82.35 
 
 
272 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  82.72 
 
 
272 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  81.99 
 
 
273 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  81.25 
 
 
273 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  80.15 
 
 
271 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  80.15 
 
 
271 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  78.83 
 
 
275 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  78.83 
 
 
275 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  78.1 
 
 
274 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  78.83 
 
 
274 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  80.88 
 
 
273 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  77.94 
 
 
271 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  77.94 
 
 
271 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  79.41 
 
 
271 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  76.47 
 
 
272 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  76.47 
 
 
272 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  78.68 
 
 
271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  78.68 
 
 
271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  79.04 
 
 
270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.46 
 
 
276 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  50.68 
 
 
294 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.9 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  47.46 
 
 
294 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  48.19 
 
 
276 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  49.09 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  47.71 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  48.76 
 
 
279 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  48.36 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  48.54 
 
 
271 aa  228  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  48.76 
 
 
279 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  46.69 
 
 
272 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  47.81 
 
 
271 aa  225  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  47.06 
 
 
271 aa  224  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  47.06 
 
 
271 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  47.59 
 
 
289 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  46.85 
 
 
283 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  47.45 
 
 
271 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  47.7 
 
 
278 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  46.69 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  46.5 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  42.19 
 
 
319 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  45.59 
 
 
271 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  45.59 
 
 
271 aa  216  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.49 
 
 
277 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  41.88 
 
 
319 aa  215  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  44.27 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  45.89 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  47.7 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  45.65 
 
 
276 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  43.07 
 
 
273 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  43.33 
 
 
273 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  45.79 
 
 
263 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  44.25 
 
 
287 aa  208  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  44.44 
 
 
281 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  47 
 
 
282 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  45.42 
 
 
262 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  47.7 
 
 
283 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  46.98 
 
 
278 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  41.84 
 
 
295 aa  206  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  45.19 
 
 
281 aa  202  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  42.71 
 
 
288 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  40.92 
 
 
304 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  42.49 
 
 
275 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  43.7 
 
 
272 aa  201  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  44.53 
 
 
263 aa  201  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  41.99 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  46.1 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  43.45 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  42.91 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  43.75 
 
 
263 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  44.25 
 
 
285 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  44.49 
 
 
265 aa  198  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  61.59 
 
 
485 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  61.59 
 
 
484 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  42.65 
 
 
266 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  47.18 
 
 
283 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  44.89 
 
 
314 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  59.28 
 
 
481 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  62.35 
 
 
394 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  46.04 
 
 
276 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  61.73 
 
 
393 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  61.73 
 
 
467 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  62.35 
 
 
468 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  43.07 
 
 
270 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  43.28 
 
 
267 aa  191  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  43.84 
 
 
274 aa  191  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  43.28 
 
 
267 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  38.58 
 
 
327 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  45.94 
 
 
284 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  40.39 
 
 
256 aa  188  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  43.11 
 
 
273 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>