More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2282 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.59 
 
 		 464 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.24 
 
 		 458 aa  695    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  75.91 
 
 		 460 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  73.32 
 
 		 474 aa  672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.13 
 
 		 460 aa  696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  75.91 
 
 		 460 aa  694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.47 
 
 		 462 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.24 
 
 		 460 aa  694    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  75.59 
 
 		 458 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 		 463 aa  948    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.24 
 
 		 458 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.03 
 
 		 458 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  73.62 
 
 		 461 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  72.12 
 
 		 470 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  76.24 
 
 		 460 aa  708    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  74.31 
 
 		 467 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.96 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000227361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  45.31 
 
 		 503 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  45.29 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.28 
 
 		 513 aa  364  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  44.79 
 
 		 484 aa  362  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02872  flagellar biosynthesis protein  42.98 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3032  GTP-binding signal recognition particle  41.5 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0741  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.95 
 
 		 487 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  48.92 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  36.14 
 
 		 437 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  38.15 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2807  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.89 
 
 		 437 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1946  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.41 
 
 		 536 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0715  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.4 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.858547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3439  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.45 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.56 
 
 		 429 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1524  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.73 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142564  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3912  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.49 
 
 		 435 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4343  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.19 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  36.51 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3874  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.67 
 
 		 429 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.9 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.37144  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  35.76 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  42.96 
 
 		 585 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.19 
 
 		 424 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.54 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3802  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.43 
 
 		 624 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2936  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.45 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0148742  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.53 
 
 		 588 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0196  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.53 
 
 		 588 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.625172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1311  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.73 
 
 		 570 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.55 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  42.55 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.31 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3923  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.31 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3168  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.03 
 
 		 577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0132  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.13 
 
 		 657 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3842  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.03 
 
 		 583 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0251  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.86 
 
 		 582 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.789642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1697  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.87 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2845  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.87 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3421  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.87 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0177  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.07 
 
 		 583 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.19 
 
 		 587 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0269  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.86 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2838  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.86 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3094  AAA ATPase  32.53 
 
 		 530 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3821  GTP-binding signal recognition particle  32.53 
 
 		 530 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.236698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3669  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.03 
 
 		 435 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2962  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.23 
 
 		 644 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168283  normal  0.0622523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3079  flagellar GTP-binding protein  41.11 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 632 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.46 
 
 		 632 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  41.47 
 
 		 615 aa  183  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1620  GTP-binding signal recognition particle  40.57 
 
 		 592 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00835044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1247  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.3 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4142  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.44 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.33 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.33 
 
 		 551 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4414  GTP-binding signal recognition particle  32.32 
 
 		 524 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0564624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  37.76 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  36.78 
 
 		 527 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  33.19 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27900  flagellar biosynthesis protein  41.73 
 
 		 758 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0457594  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.95 
 
 		 804 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.85 
 
 		 542 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.73 
 
 		 825 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0598  GTP-binding signal recognition particle  38.91 
 
 		 548 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.6 
 
 		 424 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  31.57 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  29 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3708  GTP-binding signal recognition particle  31.24 
 
 		 479 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.09 
 
 		 481 aa  156  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000866601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  39.27 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  40.09 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  29.91 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  46.32 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1178  flagellar biosynthetic protein FlhF  38.1 
 
 		 375 aa  155  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  41.67 
 
 		 441 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  40.88 
 
 		 438 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.44 
 
 		 392 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  27.69 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  42.13 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  29.87 
 
 		 395 aa  147  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>