More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2266 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  82.33 
 
 
501 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  90.98 
 
 
489 aa  855    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  82.53 
 
 
501 aa  839    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  82.53 
 
 
501 aa  838    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  80.4 
 
 
501 aa  809    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  80.92 
 
 
501 aa  807    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  80.12 
 
 
500 aa  809    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  88.89 
 
 
490 aa  864    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  86.21 
 
 
489 aa  848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  91.98 
 
 
489 aa  913    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  91.98 
 
 
489 aa  913    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  91.36 
 
 
489 aa  911    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  89.14 
 
 
491 aa  867    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
490 aa  988    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  62.97 
 
 
462 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  63.23 
 
 
451 aa  587  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  62.66 
 
 
462 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  54.49 
 
 
479 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  77.57 
 
 
324 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  44.82 
 
 
461 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  44.51 
 
 
461 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  44.51 
 
 
461 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  44.3 
 
 
461 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  44.51 
 
 
461 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  44.09 
 
 
461 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  44.3 
 
 
461 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  44.09 
 
 
461 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  44.09 
 
 
461 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  44.4 
 
 
461 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  44.09 
 
 
461 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  46.15 
 
 
461 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  43.97 
 
 
463 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  45.79 
 
 
446 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  45.79 
 
 
446 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  46.15 
 
 
461 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  45.37 
 
 
463 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  46.78 
 
 
452 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  46.78 
 
 
452 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  42.76 
 
 
449 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  42.11 
 
 
449 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  42.11 
 
 
449 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  42.32 
 
 
449 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  46.24 
 
 
504 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  45.18 
 
 
464 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  43.85 
 
 
467 aa  344  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  44.68 
 
 
463 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  44.37 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  45.29 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  45.81 
 
 
436 aa  334  2e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  41.19 
 
 
444 aa  333  6e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  38.07 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  37.87 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3195  peptide transporter  90.91 
 
 
176 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  36.8 
 
 
510 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.53 
 
 
510 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.7 
 
 
499 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  36.95 
 
 
499 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  38.24 
 
 
527 aa  294  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  37.58 
 
 
477 aa  292  9e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  35.56 
 
 
495 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  38.9 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  36.42 
 
 
502 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  36.31 
 
 
497 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.52 
 
 
497 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  36.94 
 
 
528 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  35.49 
 
 
507 aa  270  5e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  39.5 
 
 
498 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  35.62 
 
 
516 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  37.53 
 
 
558 aa  263  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  34.46 
 
 
495 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.6 
 
 
544 aa  259  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  36.15 
 
 
520 aa  259  9e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  33.69 
 
 
501 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  33.69 
 
 
501 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  35.31 
 
 
509 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  35.88 
 
 
516 aa  256  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  33.86 
 
 
501 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  33.96 
 
 
483 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  35.16 
 
 
524 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.62 
 
 
544 aa  249  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  42.45 
 
 
533 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  34.23 
 
 
490 aa  241  2e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  33.33 
 
 
497 aa  232  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.56 
 
 
512 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.56 
 
 
512 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  31.26 
 
 
499 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  31.12 
 
 
483 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  31.17 
 
 
501 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  31.17 
 
 
501 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  30.97 
 
 
501 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  30.97 
 
 
501 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  30.97 
 
 
501 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  31.2 
 
 
498 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  31.42 
 
 
484 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.47 
 
 
497 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  30.65 
 
 
500 aa  223  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  30.65 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  30.92 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  30.65 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  34 
 
 
489 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>