More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2092 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  100 
 
 		 289 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  68.86 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  68.86 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  68.86 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  68.86 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  68.86 
 
 		 290 aa  434  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  69.55 
 
 		 290 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  68.86 
 
 		 290 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  67.47 
 
 		 289 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  68.17 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  65.74 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  67.75 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  65.74 
 
 		 289 aa  407  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  63.32 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  67.5 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  47.46 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  43.86 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  45.2 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  43.07 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  41.96 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.58 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  41.13 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  67.77 
 
 		 122 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  27.94 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  27.4 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  32.56 
 
 		 322 aa  132  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  28.41 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  28.79 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  28.85 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  27.7 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  27.88 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  27.7 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  29.22 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  25.99 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  25.96 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  26.73 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  25.95 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.29 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  27.8 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  27.8 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 537 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 679 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.05 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  23.34 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  36.7 
 
 		 890 aa  73.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  38.83 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  35.77 
 
 		 641 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.15 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 214 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.62 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 210 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 544 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  23.59 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  31.91 
 
 		 673 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  33.86 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.68 
 
 		 694 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  44.16 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.63 
 
 		 424 aa  69.3  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  41.24 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  35.05 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 1026 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  43.42 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.22 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.24 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  44.74 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.08 
 
 		 670 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  44 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 		 417 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  36.7 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  35.06 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>