More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2004 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  54.1 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1792  OmpA/MotB domain-containing protein  49.2 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00059964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  48.82 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 		 245 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  53.67 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2201  OmpA/MotB domain-containing protein  48.02 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.203533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1828  OmpA/MotB domain-containing protein  51.79 
 
 		 276 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.124445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2449  OmpA/MotB domain protein  51.79 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000186851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1876  OmpA/MotB domain-containing protein  51.56 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  51.56 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000182136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2411  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00660043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3984  ompA family protein  33.6 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2194  OmpA family protein  40.74 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3921  OmpA/MotB  37.13 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.36471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2570  OmpA family protein  29.64 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  33.51 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  29.89 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  35.24 
 
 		 380 aa  75.1  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  32.04 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  32.31 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.32 
 
 		 729 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  29.09 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.57 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  29.41 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  32.31 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  33.04 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  33.33 
 
 		 1313 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  27.33 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  33.05 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  29.44 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  29.66 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  29.66 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  32.23 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.29 
 
 		 670 aa  68.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  32.31 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  25.53 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  29.95 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  25.53 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.35 
 
 		 656 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  29.46 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  36.46 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 623 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33.02 
 
 		 429 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  33.7 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 209 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  26 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  26.58 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.33 
 
 		 424 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  31.45 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  29.44 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  26.82 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  26.82 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  28.12 
 
 		 427 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  38.37 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  27.66 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  27.07 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2364  OmpA/MotB  38.64 
 
 		 167 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.550372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  29.51 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 704 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>