More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1942 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  878    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  70.44 
 
 		 443 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  67.52 
 
 		 433 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  69.63 
 
 		 433 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  69.05 
 
 		 438 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  65.66 
 
 		 438 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  69.63 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  69.63 
 
 		 433 aa  585  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  67.29 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  67.67 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  68.13 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  67.76 
 
 		 439 aa  581  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  67.9 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  67.9 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  67.67 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  63.51 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  61.27 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  61.27 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  61.5 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  61.27 
 
 		 434 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  61.03 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  61.03 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  60.8 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  60.8 
 
 		 434 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  60.42 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  58.51 
 
 		 430 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  59.95 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  60.19 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  60.19 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  60.19 
 
 		 434 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  59.62 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  61.89 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  59.03 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 436 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  57.67 
 
 		 431 aa  500  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  58.1 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  56.02 
 
 		 431 aa  484  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  58.64 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  57.64 
 
 		 442 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  57.75 
 
 		 442 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  57.34 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  58.88 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  55.61 
 
 		 435 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  58.18 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  57.64 
 
 		 436 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  54.57 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  52.9 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  51.06 
 
 		 437 aa  432  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  53.35 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  53.97 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  52.19 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  51.18 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  48.36 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  51.43 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  49.29 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  49.06 
 
 		 867 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  51.31 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  52.91 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  49.39 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  51.97 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  51.98 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  47.24 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  48.6 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  46.59 
 
 		 867 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  47.8 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  45.43 
 
 		 852 aa  361  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  47.09 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  46 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.97 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  46.7 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  44.75 
 
 		 426 aa  329  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  44.22 
 
 		 434 aa  329  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  43.75 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 		 416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  42.79 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  41.07 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.8 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  42.55 
 
 		 427 aa  318  9e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  45 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  42 
 
 		 429 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  45.07 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  42.82 
 
 		 429 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  41.27 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  42.57 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  41.86 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  44 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  40.93 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  44.25 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  44.33 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>