More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1913 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  78.12 
 
 
489 aa  805    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  79.96 
 
 
489 aa  811    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  78.75 
 
 
485 aa  797    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  76.25 
 
 
486 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  75.72 
 
 
486 aa  745    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  78.12 
 
 
489 aa  805    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  73.21 
 
 
490 aa  734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
489 aa  990    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  78.12 
 
 
489 aa  805    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  80.78 
 
 
489 aa  817    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  76.95 
 
 
486 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  76.15 
 
 
485 aa  751    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  78.12 
 
 
489 aa  805    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  80.16 
 
 
489 aa  815    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  80.16 
 
 
489 aa  812    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  76.07 
 
 
489 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  47.15 
 
 
487 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  48.95 
 
 
488 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  44.3 
 
 
483 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  46.07 
 
 
483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  45.17 
 
 
484 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  45.84 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  45.55 
 
 
484 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  46.15 
 
 
481 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  44.65 
 
 
487 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  43.21 
 
 
524 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  43.21 
 
 
494 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  43.46 
 
 
487 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  42.71 
 
 
488 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  43.21 
 
 
494 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  43.25 
 
 
487 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  43.46 
 
 
487 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  43.25 
 
 
487 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  43.25 
 
 
487 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  43.04 
 
 
487 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  43.46 
 
 
487 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  42.83 
 
 
487 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  42.83 
 
 
487 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  43.37 
 
 
487 aa  362  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  43.1 
 
 
487 aa  359  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  42.76 
 
 
487 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
484 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.89 
 
 
503 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  33.76 
 
 
473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.46 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  35.17 
 
 
478 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  35.17 
 
 
478 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  35.17 
 
 
478 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  35.38 
 
 
478 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  34.28 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  34.52 
 
 
477 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  34.28 
 
 
477 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  34.1 
 
 
477 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
500 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  34.53 
 
 
477 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.09 
 
 
479 aa  230  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1366  peptidase M48, Ste24p  33.91 
 
 
477 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  36.77 
 
 
490 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  33.8 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  34.03 
 
 
478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  31.74 
 
 
483 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  31.94 
 
 
605 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  34.58 
 
 
486 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.63 
 
 
518 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  32.59 
 
 
480 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  31.65 
 
 
561 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 
569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  29.66 
 
 
565 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.85 
 
 
567 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30.84 
 
 
573 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35380  Peptidase, M48 family  33.67 
 
 
411 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
474 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  39.66 
 
 
494 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  31.78 
 
 
533 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  28.17 
 
 
566 aa  186  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  31.01 
 
 
562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  28.4 
 
 
533 aa  177  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  37.91 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  37.55 
 
 
568 aa  173  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  29.46 
 
 
590 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  29.19 
 
 
569 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  29.18 
 
 
521 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 
588 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 
588 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  28.96 
 
 
564 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  30.6 
 
 
564 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  29.26 
 
 
589 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  30.6 
 
 
564 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 
588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  33.76 
 
 
533 aa  156  7e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.43 
 
 
560 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  29.87 
 
 
593 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>