More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1897 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  100 
 
 		 309 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  74.41 
 
 		 303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  72.39 
 
 		 303 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  73.49 
 
 		 303 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  72.05 
 
 		 303 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  70.03 
 
 		 303 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  70.23 
 
 		 303 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  74.3 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  73.24 
 
 		 303 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  73.24 
 
 		 303 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  75 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  74.65 
 
 		 303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  74.65 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.59 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  68.77 
 
 		 303 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  68.35 
 
 		 315 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  67.01 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  63 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  58.61 
 
 		 305 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  55.56 
 
 		 303 aa  339  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  53.99 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  59.14 
 
 		 305 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  57.04 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  59.14 
 
 		 305 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  56.08 
 
 		 302 aa  329  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  57.99 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  58.42 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  58.09 
 
 		 305 aa  325  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  55.1 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  56.15 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  60.07 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.79 
 
 		 300 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.59 
 
 		 323 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.59 
 
 		 323 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.67 
 
 		 317 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  53.64 
 
 		 315 aa  315  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  50.62 
 
 		 350 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  56.12 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  56.19 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.56 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  55.52 
 
 		 305 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.73 
 
 		 331 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  54.45 
 
 		 317 aa  309  5e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.11 
 
 		 317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  54.8 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  54.09 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  53.96 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  54.32 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  54.96 
 
 		 306 aa  301  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  56.54 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  56.69 
 
 		 315 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.05 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.5 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  53.76 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  52.03 
 
 		 304 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  51.69 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.66 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  55.25 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  50 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  49.83 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  53.6 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  49.66 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  46.23 
 
 		 314 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  48.56 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.43 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.85 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  51.55 
 
 		 317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.3 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  48.41 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  47.27 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.08 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  53.87 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  45.79 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.74 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.44 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  51.44 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.64 
 
 		 325 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  47.83 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  45.85 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.24 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  45.07 
 
 		 305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.82 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  48.5 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  43.62 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.5 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  49.43 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  48.81 
 
 		 359 aa  271  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.14 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.06 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.5 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.74 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  47.69 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  49.15 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.78 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  47.87 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.47 
 
 		 341 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3709  ATPase  47.69 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.79 
 
 		 330 aa  265  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.35 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.32 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.916735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>