186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1717 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  72.65 
 
 		 592 aa  915    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  69.31 
 
 		 609 aa  878    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  72.39 
 
 		 596 aa  921    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  72.39 
 
 		 596 aa  922    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  69.9 
 
 		 599 aa  889    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  72.61 
 
 		 596 aa  923    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  71.43 
 
 		 590 aa  901    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  100 
 
 		 595 aa  1235    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  71.6 
 
 		 590 aa  901    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  70.92 
 
 		 590 aa  888    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  71.26 
 
 		 590 aa  898    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  73.23 
 
 		 592 aa  928    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  72.85 
 
 		 590 aa  918    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  70.03 
 
 		 591 aa  882    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  71.6 
 
 		 590 aa  902    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  72.77 
 
 		 592 aa  924    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  33.63 
 
 		 602 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4531  hypothetical protein  33.16 
 
 		 582 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0197  protein of unknown function DUF885  32.17 
 
 		 578 aa  280  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  30.29 
 
 		 635 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1952  hypothetical protein  29.98 
 
 		 542 aa  257  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  28.9 
 
 		 536 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0887  hypothetical protein  28.67 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  26.95 
 
 		 542 aa  210  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0817  protein of unknown function DUF885  26.54 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0452595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  25.79 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  25.93 
 
 		 575 aa  150  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0417  protein of unknown function DUF885  25.26 
 
 		 581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2107  hypothetical protein  23.54 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.688349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  22.52 
 
 		 617 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  23.2 
 
 		 614 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  23.29 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  22.41 
 
 		 616 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  24.51 
 
 		 540 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  21.89 
 
 		 615 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  21.94 
 
 		 616 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  22.2 
 
 		 615 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  21.94 
 
 		 616 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  21.77 
 
 		 615 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  21.89 
 
 		 616 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  26.55 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  24.68 
 
 		 496 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  23.12 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  23.9 
 
 		 583 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  21.53 
 
 		 628 aa  94.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  21.79 
 
 		 615 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1181  putative secreted protein  27 
 
 		 506 aa  92.8  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  23.02 
 
 		 605 aa  91.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  20.88 
 
 		 627 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  22.53 
 
 		 618 aa  90.1  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  21.9 
 
 		 625 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  23.2 
 
 		 613 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  22.18 
 
 		 587 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  20.96 
 
 		 617 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  23.76 
 
 		 624 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  27.54 
 
 		 609 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  23.5 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  26.3 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  23.11 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0473  protein of unknown function DUF885  25.81 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  23.11 
 
 		 603 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  23.03 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  21.53 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  23.08 
 
 		 603 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  23.7 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  30.18 
 
 		 621 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  24.85 
 
 		 628 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  21.34 
 
 		 618 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  28.08 
 
 		 610 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  22.17 
 
 		 616 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  21.84 
 
 		 1283 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  22.27 
 
 		 603 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  27.04 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  23.74 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  24.43 
 
 		 621 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  24.32 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  22.1 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  26.5 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  26.56 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  23.66 
 
 		 595 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  28.27 
 
 		 609 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  28.82 
 
 		 635 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  28.27 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  28.27 
 
 		 609 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  29.03 
 
 		 616 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  22.09 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  28.27 
 
 		 611 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  27.32 
 
 		 609 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  22.2 
 
 		 591 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  28.82 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  24.23 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  28.82 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  24.04 
 
 		 619 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  22.94 
 
 		 599 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  25.33 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  19.94 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  27.49 
 
 		 607 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  27.49 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  27.49 
 
 		 607 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  26.17 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>